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dc.contributor.advisorBashan, Yoaves_MX
dc.contributor.authorPuente, María Estheres_MX
dc.date.issued2004es_MX
dc.identifier.urihttp://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/82
dc.description.abstractProcesos biológicos, físicos y químicos contribuyen a la degradación de roca y formación de suelo, que a su vez se vuelve sustrato ó nutriente para el crecimiento de la planta. En los ambientes extremos, organismos pequeños y microorganismos, incluyendo líquenes, hongos, cianobacterias, bacterias, y microalgas, residen sobre la superficie de rocas y partículas de minerales, contribuyendo a la fragmentación de la roca. La degradación de rocas por microorganismos existe en todas las zonas climáticas, siendo un proceso muy lento, tanto en desiertos calientes como fríos. Se conoce poco sobre los mecanismos involucrados en este proceso, salvo que algunos microorganismos producen ácidos que han sido detectados en las rocas degradadas. La degradación mineral por la interacción de microorganismos benéficos y plantas acelera la remoción mineral, haciendo disponible los elementos inorgánicos para la nutrición de la planta. Como resultado de esta asociación planta-bacteria, algunas plantas del desierto, principalmente cactáceas, crecen sin suelo, estableciéndose sobre roca, en lugares poco accesibles, tales como precipicios, logrando sobrevivir en estas condiciones extremas. Esto pasa en una balanza de tiempo geológica más rápida, que por degradación de roca por procesos físicos (viento y lluvia). En este estudio mostramos la participación de bacterias endófitas del interior de las semillas de cardón cactus (Pachycereus pringlei) y de bacterias de rizoplano de cactáceas en la degradación de roca volcánica y sedimentaria en un desierto de temperaturas extremas, subtropical, de escasa precipitación pluvial. Estas bacterias endófitas son necesarias para las plantas pioneras establecidas sobre roca ígnea, ya que crean partículas finas de estas rocas, que pueden ser favorables para el consumo y utilización por la misma planta y por otras plantas. Estas especies de cactus, junto con otras plantas del desierto, son responsables de la degradación de roca volcánica en la zona de La Purísima-San Isidro y en la roca sedimentaria de Sierra de La Paz, ambos en Baja California Sur, México. Este estudio, a través de microscopía de luz, fluorescente, y electrónica de barrido, junto con métodos químicos, moleculares y microbiológicos reveló capas densas de bacterias y hongos en el rizoplano de tres especies de cactus (Pachycereus pringlei, Stenocereus thurberi, Opuntia cholla), un árbol de higo silvestre (Ficus palmeri) creciendo en rocas sin suelo. También reveló la presencia de población abundante de bacterias endófitas dentro de semillas de plantas silvestres del cardón cactus, así como en plántulas que crecieron de estas semillas, y en plantas pequeñas del cardón cactus. La presencia de bacterias en espacios intercelulares tanto en raíz como en semilla y en la región de transición entre la raíz y tallo de plántulas de cardón indica que son endófitas de esta planta. Los grupos bacterianos que colonizan el rizoplano de estas plantas pertenecieron en su mayoría a los géneros Pseudomonas y Bacilos. Ocho de estas especies bacterianas fueron identificados por el método molecular 16s rRNA. Hongos y actinomicetos no identificados fueron observados. Las endófitas aisladas del cardón cactus fueron varias especies del género Bacillus, Klebsiella spp., Pseudomonas putida y Staphylococcus spp. De las 26 cepas endófitas aisladas, solo 13 fueron identificadas por el método 16s rRNA. Algunas de las bacterias endófitas y colonizadoras de rizoplano fijaron nitrógeno en experimentos in vitro, siendo las bacterias endófitas de semillas de cardón Klebsiella oxitoca spp, la especie que posee mayor capacidad de reducción de acetileno a etileno. Las bacterias endófitas y colonizadoras de rizoplano produjeron ácidos orgánicos volátiles y no-volátiles en medio que contenía roca pulverizada. Estos ácidos redujeron el pH del medio, disolviendo significativamente fosfatos insolubles, roca ígnea, mármol y piedra caliza. Las bacterias removieron cantidades significativas de minerales, tales como P, K, Mg, Mn, Fe, Cu, y Zinc de las rocas y redujeron el tamaño de partículas de roca a más pequeñas, creando así suelo. La mayoría fueron termo-tolerantes, halo-tolerantes a NaCl y posiblemente tolerantes a la desecación. La capacidad de las bacterias para sobrevivir en medio basal con roca volcánica por remoción de minerales, indica la participación directa en el aporte de nutrientes para las cactáceas que crecen sobre roca volcánica. Plantas del cardón cactus crecidas a partir de semillas desinfectadas e inoculadas con bacterias aisladas de rizoplano, y con endófitas aisladas de semilla de cardón fueron capaces de crecer durante un año en roca volcánica pulverizada, piedra pómez y basalto sin nitrógeno y fósforo, sin mostrar ningún tipo de estrés. Cactus no inoculados crecieron menos vigorosos en roca volcánica y algunos murieron. La cantidad de minerales removidos de la roca pulverizada, medidos después del cultivo de plantas inoculadas, fue significativa. Las plantas contienen posiblemente las mismas especies de endófitas en sus tejidos derivados de semillas. Esta asociación planta-bacteria de ambientes extremos podría servir como un factor en la aceleración de formación de suelo en desiertos. Debido a que estas bacterias son esenciales para el crecimiento de la planta, ya que sin ellas la planta crece menos vigorosa, ellas podrían ser consideradas como bacterias promotoras del crecimiento para cactáceas. La solubilización de fosfatos inorgánicos y rocas por actividad microbiana asociada a las raíces de cardón, higo y cholla, así como por bacterias endófitas de cardón ha sido demostrada en este trabajo. En conclusión, este estudio demostró que las bacterias colonizadoras de rizoplano de cactáceas y endófitas del cardón cactus son posiblemente uno de los factores involucrados en el proceso de degradación de roca volcánica en zonas de poca precipitación pluvial y temperaturas extremas como lo es el desierto subtropical. Esta asociación planta-bacteria acelera la formación de suelo significativamente en un ambiente, donde la degradación de roca por procesos químicos y físicos debidos a las condiciones climáticas tarda miles de años. Este es el primer reporte de bacterias endófitas en raíz, tallo y semilla de cardón.es_MX
dc.language.isoeses_MX
dc.publisherCentro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.es_MX
dc.titlePoblaciones bacterianas endófitas y del rizoplano de plantas del desierto degradadoras de roca y su efecto sobre el crecimiento del cardónes_MX
dc.documento.idcibnor.2004.puente_mes_MX
dc.documento.indicepuente_mes_MX
dc.documento.instcibnores_MX
dc.dirtesis.gradoDoctorado en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturaleses_MX
dc.dirtesis.disciplinaEcologíaes_MX
dc.dirtesis.universidadCentro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.es_MX
dc.dirtesis.facultadPosgrado en Recursos Naturaleses_MX
dc.documento.fechaMayo, 2004es_MX
dc.description.abstractenBiological as well as physical and chemical processes contribute to rock weathering and soil development, which, in turn becomes substrate for plant growth. In extreme environments, small organisms and microorganisms such as lichens, fungi, cyanobacteria, bacteria, and microalgae, occupy the surface of rocks and minerals, and contribute to the breakdown of unweathered rocks. Rock weathering by microbes exists in all climate zones, but is usually a slow process observed in both hot and cold deserts. Little is known about the mechanisms involved in this process, except that some microorganisms produce acids that are detectable in weathered rocks. Mineral weathering benefits microbes and plants by making inorganic elements available. As a result of this plant-bacteria association, several desert plants, mainly cacti, grow without soil, in noticeably weathered rock and difficult-to-establish localities, such as cliffs. This happens on a faster geological time scale than physical weathering by wind and rain. Here we show the involvement of endophytic bacteria found in the seeds of the giant cardón cactus (Pachycereus pringlei) and of rhizoplane bacteria weathering of volcanic and sedimentary in a hot, subtropical desert, a region that remains dry almost all year. These endophytic bacteria are necessary for pioneer plants to colonize igneous rocks and create fine materials from these rocks that become available to them and to other plants. This species of cactus, together with other desert plants, are responsible for rock weathering in ancient lava flows of La Purisima-San Isidro and in the sedimentary rock of Sierra de La Paz, both places located in Baja California Sur, Mexico. This study, using light, fluorescent, and field emission scanning electron microscopy, together with chemical, molecular and microbiological methods, revealed dense layers of bacteria and fungi in the rhizoplane of cardon, the cacti Stenocereus thurberi, Opuntia cholla), the wild fig tree (Ficus palmeri) . They also revealed a high population density of endophytic bacteria inside seeds from wild plants, in seedlings growing from these seeds, and in small wild plants. The presence of bacteria in the intercellular root and seed spaces and in the transition region between the root and stem of cardón seedlings indicates that they are endophytes of this plant. The dominant bacterial groups colonizing the rhizoplane were fluorescent pseudomonads and species of Bacillus. Eight of these bacterial species were identified by the 16s rRNA molecular method. Unidentified fungal and actimomycete species were also present. The isolated endophytes of cardon were several species of Bacillus, Klebsiella spp. Pseudomonas putida and Staphylococcus spp. Out of 26 cultivable endophytic strains, thirteen were identified by the 16s rRNA molecular method. Some of the endophytes and root-colonizing bacteria fixed N2 in vitro, being the endophytic bacterium of cardón seeds Klebsiella oxitoca spp, the most capable species to reduce acetylene to ethylene. The endophytic and rhizoplane bacteria produced volatile and no-volatile organic acids in rock medium. These acids reduced the pH of the rock medium in which the bacteria grew, and significantly dissolved insoluble phosphates, extrusive igneous rock, marble, and limestone. The bacteria were able to release significant amounts of minerals such as P, K, Mg, Mn, Fe, Cu, and Zn from the rocks and to reduce the size of rock particles thus creating soil. Most of them were thermo-tolerant, halo-tolerant, and possibly desiccation tolerant. The capacity of the bacteria to survive in a basal medium with volcanic rock indicates their direct participation contributing nutrients to the cacti that grow on volcanic rock. When plants were inoculated with rhizoplane and endophytic bacteria onto disinfected cardon seeds, the plants were capable of growing in crushed lava rock powder, pumice and basalt for a year, without fertilization and without showing any signs of stress. Non-inoculated cacti grew less vigorously in lava rock powder and some died. The amount of minerals for plant growth released from the pulverized lava and measured after cultivation of inoculated plants, was significant. These plants contain the same species of endophytes in their shoots possibly derived from the seeds. This plant–bacteria association may serve as a factor in acceleration of soil formation in deserts. As they are essential for plant growth, as plant without them grew less vigorous, they should be considered as plant growth-promoting bacteria for cacti. The solubilization of inorganic phosphates and rocks by bacteria associated to cardón, fig tree and cholla roots as well as by endophytic bacteria from cardón, has been demonstrated. In conclusion, this study showed that rhizoplane bacteria colonizing cacti as well as endophytic bacteria of cardón, are implicated in the process of rock weathering by cacti in areas with very little rain and extreme temperature such as the subtropical desert. Our studies also showed that this plant-bacteria association significantly accelerated soil formation in an extreme environment that would otherwise have very slow rock weathering. This is the first report of endophytic bacteria in roots, stems and seeds of cardón.es_MX
dc.documento.subjectCactus; bacterias; endófitas; rizoplano; higo; pseudomonas; bacilos; degradación de roca; solubilización de fosfato; fijación de nitrógeno; formación de suelo; remoción mineral; ácidos orgánicoses_MX


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