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Geminivirus en tomate en Baja California Sur: identificación, caracterización y epidemiología
dc.contributor.advisor | Vázquez Juárez, Ricardo | es_MX |
dc.contributor.advisor | Rivera Bustamante, Rafael F. | es_MX |
dc.contributor.author | Holguín Peña, Ramón Jaime | es_MX |
dc.date.issued | 2004 | es_MX |
dc.identifier.uri | http://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/65 | |
dc.description.abstract | Al estudiar la etiología de la enfermedad del “enchinado foliar” en el cultivo del tomate en Baja California Sur (BCS), se detectaron tres geminivirus no descritos y uno previamente reportado en México. Las pruebas de DAS-ELISA, la separación electroforética de la forma replicativa (FR) del ADN viral, los análisis de hibridación molecular y la amplificación por PCR nos indicaron que estos geminivirus tienen dos moléculas de ADN de cadena sencilla (bipartitas) y que pertenecen al género Begomovirus. Las reacciones de PCR fueron realizadas con iniciadores genéricos y específicos que amplifican los genes: AV1 (CP), AC1 (Rep), AC2 (TraP), AC3 (REn), incluyendo la región intergénica (RI). Los productos de PCR clonados y secuenciados se compararon por alineamientos locales (BLAST) usando como referencia los geminivirus de la base de datos del NCBI (GenBank). Las secuencias que produjeron las más altas identidades fueron comparadas por alineaciones múltiples en el programa MegAlign (DNASTAR) basados en la secuencia nucleotídica (nt) completa del componente A (ADN-A) o en un fragmento (RI-1.1 kb) que incluye la región amino terminal de Rep y CP, así como la RI. En el área de La Paz se detectó un geminivirus con un 73.8 % (nt) de identidad (ADN-A) con el virus del enrollamiento severo del tomate (Tomato severe leaf curl virus-ToSLCV) y un 83.8 % de identidad (RI-1.1 kb) con un geminivirus parcialmente caracterizado, tentativamente nombrado virus del jaspeado ligero del tomate (Tomato mild mottle virus, ToMMoV). En la misma región se encontró un geminivirus con un 98 % de identidad (RI-1.1 kb) con la variante de Tamaulipas del virus del mosaico dorado del chile (Pepper golden mosaic virus-PepGMV-[Tam]). En la región de el Calandrio se detectó un geminivirus con un 82.8 % de identidad (RI-1.1 kb) con el ToSLCV. Finalmente, en el Carrizal se detectó un geminivirus con la identidad más alta (90.2%) con el virus aislado de La Paz. Basados en los análisis de identidad, filogenia y estructura de iterones estos geminivirus fueron designados como: chino del tomate de La Paz (Tomato chino de La Paz virus-ToChLPV [AY339618]), chino del tomate de el Calandrio (Tomato chino Calandrio virus-TChCV [AY336088]) y chino del tomate de Baja California Sur (Tomato chino Baja California Sur virus-ToChBCSV [AY339619]). Los virus fueron experimentalmente inoculados por varios métodos, observándose diferentes eficiencias de transmisión (EfT). Mecánicamente se obtuvo una EfT de 35% y un 100% por biobalística y por injerto, mientras que por medio de mosquitas blancas (mb) se obtuvo una EfT del 65 al 83.3 %. Los síntomas observados en las plantas infectadas experimentalmente (arrugamientos foliares, mosaicos, enanismo y reducción de foliolos) fueron similares a los observados en infecciones naturales. El rango de hospedantes se encontró delimitado a la familia Solanaceae, donde el tomate y el chile son hospedantes naturales, mientras que el tomatillo (Physalis ixocarpa), toloache (Datura discolor) y tabaquillo (Nicotiana glauca [asintomática]) se encontraron como hospedantes alternos. Las poblaciones más altas de mb fueron registradas en junio (11 mb/hoja) coincidiendo con las altas incidencias (92-100%) de la enfermedad y altos niveles de severidad (9 en escala de 1-10). Se detectó la presencia de los biotipos A y B de Bemisia tabaci, transmisores específicos de estos geminivirus e involucrados con la enfermedad del “chino del tomate de BCS”. | es_MX |
dc.language.iso | es | es_MX |
dc.publisher | Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | es_MX |
dc.title | Geminivirus en tomate en Baja California Sur: identificación, caracterización y epidemiología | es_MX |
dc.documento.id | cibnor.2004.holguin_r | es_MX |
dc.documento.indice | holguin_r | es_MX |
dc.documento.inst | cibnor | es_MX |
dc.dirtesis.grado | Doctorado en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales | es_MX |
dc.dirtesis.disciplina | Biotecnología | es_MX |
dc.dirtesis.universidad | Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | es_MX |
dc.dirtesis.facultad | Posgrado en Recursos Naturales | es_MX |
dc.documento.fecha | Junio, 2004 | es_MX |
dc.description.abstracten | In the aim to study the etiology of the tomato “chino” leaf curl disease in Baja California Sur (BCS) tomato crops, three new geminiviruses and one previously reported in Mexico were detected. DAS-ELISA, electrophoresis motility of DNA replicative form (RF), DNA hybridization and PCR assays, as well as, sequences analysis indicated that these geminivirus have two single-stranded DNA molecules (bipartite) and belong to the genus Begomovirus. PCR reactions were realized using specific and degenerate primers that target the AV1 (CP), AC1 (Rep), AC2 (Trap), AC3 (REn) genes, including the intergenic region (IR). Amplicons were cloned and sequenced and compared by local alignment (BLAST) to other geminiviruses and of the NCBI data base (GenBank). The nucleotide (nt) sequences with the highest scores were analyzed by multiple alignments using MegAlign (DNASTAR), based on the identities percentages of the complete DNA-A sequence, either in the fragment (IR-1.1 kb) that includes the amino termini region of Rep and CP as well as the IR. A geminivirus sharing a 73.8% nt identity (DNA-A) to Tomato severe leaf curl virus (ToSLCV) and 83.8% (IR-1.1 kb) to the partially characterized Tomato mild mottle virus (ToMMoV) was detected in La Paz. In the same region, a geminivirus sharing 98% (IR-1.1 kb) nt identity to Pepper golden mosaic virus-PepGMV Tamaulipas strain was found. An isolate from the Calandrio area shared 82.8% nt sequence identity (IR-1.1 kb) to ToSLCV. Finally, the geminivirus found in the Carrizal shared the highest nt identity (90.2%) to the La Paz isolate. Based on the nt identity, phylogeny and structural analysis of iterons these geminivirus were named: Tomato chino La Paz virus-ToChLPV (AY339618), Tomato chino Calandrio virus-TChCV (AY336088), and Tomato chino Baja California Sur virus-ToChBCSV (AY339619). These viruses were experimentally transmitted by several methods, being observed different transmission efficiency (TEf). By mechanical methods a TEf of 35% and 100% by grafting and biolistically methods were observed, whereas, a TEf of 65 to 83.3% by whiteflies (wf) were observed. The symptoms observed in the experimental infected plants (leaf curling, mosaic patterns, stunting and reduced leaf size) were similar from those observed in the field. The host range was found delimited to the family Solanaceae, where tomato and peppers were the natural hosts, whereas, green tomato (Physalis ixocarpa), jimsonweed (Datura discolor) and wild tobacco (Nicotiana glauca [asymptomatic]) were alternate hosts. The highest population density of wf was registered in June (11 wf/leaf), matching with the highest incidences (92% to 100%) and high severity levels (9 in a 1-10 scale) of the disease. Bemisia tabaci biotypes A and B, specific transmitter of these viruses and associated to the tomato leaf curl “chino” disease in BCS fields were detected. | es_MX |
dc.documento.subject | Begomovirus; Bemisia spp.; virus de ADN de plantas | es_MX |
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