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dc.contributor.advisorGómez Anduro, Gracia
dc.contributor.advisorAscencio Valle, Felipe
dc.contributor.authorRojas Arzaluz, Mario
dc.date.issued2016es_MX
dc.identifierhttp://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/354
dc.identifier.urihttp://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/541
dc.description.abstractEste estudio está encaminado a entender la diversidad funcional existente en una familia de proteínas β-glucosidasas de Zea mays. La familia de genes que codifica para β-glucosidasa (BGLU EC 3.2.1.21) en Zea mays cv. B73 se compone de 26 genes parálogos de redundancia funcional desconocida. En otras especies de plantas se ha descrito que las BGLU cumplen diferentes funciones: activando reguladores de crecimiento como el jasmónico, salicílico y abscísico en respuesta a estrés biótico y abiótico; además de actuar en otras moléculas que participan directamente en la defensa contra patógenos, reciclaje de la pared celular, señalización y metabolismo secundario. En este trabajo se realizaron análisis bioinformáticos que permitieron: (1) asociar posibles funciones de los miembros ZmBGLU a partir de la homología con ortólogos de Arabidopsis y arroz; (2) revelar la redundancia y los patrones de expresión de estos genes así como los niveles máximos y mínimos de expresión en diferentes tejidos de la planta, al analizar la expresión durante el desarrollo vegetativo y reproductivo del Z. mays; (3) el análisis de regiones promotoras de 2000 pb rio arriba del codón de inicio en 4 genes ZmBGlu los cuales mostraron posibles sitios de unión a factores de transcripción (TFBS), con afinidad a los siguientes factores de transcripción (TF): DOF, O2, Interlower, DRE, MYB, entre otros; asociados a la respuesta al ataque por patógenos y algunos en respuesta a estrés abiótico. A continuación se evaluó la expresión de 10 miembros ZmBGlu en plántulas de maíz B73 bajo estrés biótico (condiciones biotróficas y necrotróficas) y abiótico (salinidad, sequía y radiación UV). Los TFBS más redundantes en los promotores ZmBGlu analizados fueron AAAG, que son reconocidos por el motivo estructural de un dedo de Zinc de los TF DOF1 y 2. Como parte de la caracterización de proteínas que se unen a las regiones promotoras ZmBGlu, al analizar el genoma de maíz encontramos 45 genes que codifican para proteínas que contienen el motivo DOF, por otra parte bajo experimentos de inmuno-precipitación de la cromatina, específicos para los TF DOF1 y DOF2 mediante qPCR se confirmó la interacción con el TFBS AAAG en los promotores de genes involucrados en la síntesis de carbohidratos. Por último se implementó un protocolo de transformación transitoria en plántulas de maíz, donde se evalúo la funcionalidad de los promotores ZmBGlu2, 5, 7 y 12, mediante el uso del gen reportero udiA. Encontrando que los promotores ZmBGlu2 y 5 mantienen una expresión similar al promotor 35S CaMV, en la etapa de desarrollo estudiada y en las condiciones de co-cultivo. Bajo el mismo esquema de transformación transitoria fué posible producir el antígeno MAP85 de Mycobacterium avium susp paratuberculosis.es_MX
dc.language.isoEspañoles_MX
dc.publisherCentro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.es_MX
dc.titleCaracterización de promotores de genes β-glucosidasa en Zea mays y su potencial en la producción de proteínas heterólogases_MX
dc.typeTesises_MX
dc.dirtesis.gradoDoctorado en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturaleses_MX
dc.dirtesis.disciplinaBiotecnologíaes_MX
dc.dirtesis.universidadCentro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.es_MX
dc.dirtesis.facultadPosgrado en Recursos Naturaleses_MX
dc.description.abstractenThis study was directed to understand functional diversity in a protein family of the β-Glucosidases in Zea mays. The family of genes that codify for β-glucosidase (BGLU EC 3.2.1.21) in Zea mays cv. B73 is composed of 26 paralogs genes of unknown functional redundancy. In other plant species, it has been described that BGLU have different functions, such as activating growth regulators as jasmonic, salicilic, and abscisic acids in response to biotic and abiotic stress besides acting in other molecules that participate directly in defense against pathogens, recycling the cellular wall, signaling, and secondary metabolism. Bioinformatic analyses were performed in this work allowing: (1) associating possible functions of ZmBGLU members starting from homology with Arabidopsis and rice orthologs; (2) revealing redundancy and expression patterns of these genes as well as maximum and minimum expression levels in different plant tissues by analyzing expression during vegetative and reproductive development stages of Z. mays; (3) analyzing promoting regions of 2000 pb above the starting codon in 4 genes of ZmBGlu, which showed the following transcription factors (TF): DOF, O2, Interlower, DRE, MYB, among others, associated to pathogen attack response and some in response to abiotic stress. After that, the expression of 10 members of ZmBGlu was assessed in B73 maize seedlings under biotic stress (biotrophic and necrotrophic conditions) and abiotic (salinity, drought and UV radiation). The most redundant TFBS in the analyzed ZmBGlu promoters were AAAG, which are known by their structural motif of a Zinc finger of TF DOF1 and 2. As part of protein characterization that joins the promoting ZmBGlu units while analyzing the maize genome, 45 genes that codify proteins were found containing the DOF motif. On the other hand, under experiments of immune-precipitation of chromatin specific for TF DOF1 and DOF2, TFBS AAAG was confirmed in the gene promoters involved in the carbohydrate synthesis by qPCR interaction. Finally, a transitory transformation protocol was implemented in maize seedlings where functionality of the ZmBGlu2, 5, 7, and 12 promoters was assessed by using the reporter gen udiA gene. The ZmBGlu2 and 5 promoters were found to maintain a similar expression to that of 35S CaMV promoter in the development stage studied and in the conditions of the co-cultivation. Under the same transitory transformation protocole, it was possible to produce the MAP85 antigen of Mycobacterium avium susp paratuberculosis.es_MX
dc.documento.subjectMaíz; Glucosil hidrolasas; Promotores de expresión; Familia multigénica; proteína heterólogaes_MX


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