dc.contributor.advisor | Gómez Anduro, Gracia | |
dc.contributor.advisor | Ascencio Valle, Felipe | |
dc.contributor.author | Rojas Arzaluz, Mario | |
dc.date.issued | 2016 | es_MX |
dc.identifier | http://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/354 | |
dc.identifier.uri | http://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/541 | |
dc.description.abstract | Este estudio está encaminado a entender la diversidad funcional existente en una
familia de proteínas β-glucosidasas de Zea mays. La familia de genes que codifica
para β-glucosidasa (BGLU EC 3.2.1.21) en Zea mays cv. B73 se compone de 26
genes parálogos de redundancia funcional desconocida. En otras especies de
plantas se ha descrito que las BGLU cumplen diferentes funciones: activando
reguladores de crecimiento como el jasmónico, salicílico y abscísico en respuesta
a estrés biótico y abiótico; además de actuar en otras moléculas que participan
directamente en la defensa contra patógenos, reciclaje de la pared celular,
señalización y metabolismo secundario. En este trabajo se realizaron análisis
bioinformáticos que permitieron: (1) asociar posibles funciones de los miembros
ZmBGLU a partir de la homología con ortólogos de Arabidopsis y arroz; (2) revelar
la redundancia y los patrones de expresión de estos genes así como los niveles
máximos y mínimos de expresión en diferentes tejidos de la planta, al analizar la
expresión durante el desarrollo vegetativo y reproductivo del Z. mays; (3) el
análisis de regiones promotoras de 2000 pb rio arriba del codón de inicio en 4
genes ZmBGlu los cuales mostraron posibles sitios de unión a factores de
transcripción (TFBS), con afinidad a los siguientes factores de transcripción (TF):
DOF, O2, Interlower, DRE, MYB, entre otros; asociados a la respuesta al ataque
por patógenos y algunos en respuesta a estrés abiótico. A continuación se evaluó
la expresión de 10 miembros ZmBGlu en plántulas de maíz B73 bajo estrés biótico
(condiciones biotróficas y necrotróficas) y abiótico (salinidad, sequía y radiación
UV). Los TFBS más redundantes en los promotores ZmBGlu analizados fueron
AAAG, que son reconocidos por el motivo estructural de un dedo de Zinc de los TF
DOF1 y 2. Como parte de la caracterización de proteínas que se unen a las
regiones promotoras ZmBGlu, al analizar el genoma de maíz encontramos 45
genes que codifican para proteínas que contienen el motivo DOF, por otra parte
bajo experimentos de inmuno-precipitación de la cromatina, específicos para los
TF DOF1 y DOF2 mediante qPCR se confirmó la interacción con el TFBS AAAG
en los promotores de genes involucrados en la síntesis de carbohidratos. Por
último se implementó un protocolo de transformación transitoria en plántulas de
maíz, donde se evalúo la funcionalidad de los promotores ZmBGlu2, 5, 7 y 12,
mediante el uso del gen reportero udiA. Encontrando que los promotores ZmBGlu2
y 5 mantienen una expresión similar al promotor 35S CaMV, en la etapa de
desarrollo estudiada y en las condiciones de co-cultivo. Bajo el mismo esquema de
transformación transitoria fué posible producir el antígeno MAP85 de
Mycobacterium avium susp paratuberculosis. | es_MX |
dc.language.iso | Español | es_MX |
dc.publisher | Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | es_MX |
dc.title | Caracterización de promotores de genes β-glucosidasa en Zea mays y su potencial en la producción de proteínas heterólogas | es_MX |
dc.type | Tesis | es_MX |
dc.dirtesis.grado | Doctorado en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales | es_MX |
dc.dirtesis.disciplina | Biotecnología | es_MX |
dc.dirtesis.universidad | Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | es_MX |
dc.dirtesis.facultad | Posgrado en Recursos Naturales | es_MX |
dc.description.abstracten | This study was directed to understand functional diversity in a protein family of the
β-Glucosidases in Zea mays. The family of genes that codify for β-glucosidase
(BGLU EC 3.2.1.21) in Zea mays cv. B73 is composed of 26 paralogs genes of
unknown functional redundancy. In other plant species, it has been described that
BGLU have different functions, such as activating growth regulators as jasmonic,
salicilic, and abscisic acids in response to biotic and abiotic stress besides acting in
other molecules that participate directly in defense against pathogens, recycling
the cellular wall, signaling, and secondary metabolism. Bioinformatic analyses
were performed in this work allowing: (1) associating possible functions of
ZmBGLU members starting from homology with Arabidopsis and rice orthologs; (2)
revealing redundancy and expression patterns of these genes as well as maximum
and minimum expression levels in different plant tissues by analyzing expression
during vegetative and reproductive development stages of Z. mays; (3) analyzing
promoting regions of 2000 pb above the starting codon in 4 genes of ZmBGlu,
which showed the following transcription factors (TF): DOF, O2, Interlower, DRE,
MYB, among others, associated to pathogen attack response and some in
response to abiotic stress. After that, the expression of 10 members of ZmBGlu
was assessed in B73 maize seedlings under biotic stress (biotrophic and
necrotrophic conditions) and abiotic (salinity, drought and UV radiation). The most
redundant TFBS in the analyzed ZmBGlu promoters were AAAG, which are known
by their structural motif of a Zinc finger of TF DOF1 and 2. As part of protein
characterization that joins the promoting ZmBGlu units while analyzing the maize
genome, 45 genes that codify proteins were found containing the DOF motif. On
the other hand, under experiments of immune-precipitation of chromatin specific for
TF DOF1 and DOF2, TFBS AAAG was confirmed in the gene promoters involved
in the carbohydrate synthesis by qPCR interaction. Finally, a transitory
transformation protocol was implemented in maize seedlings where functionality of
the ZmBGlu2, 5, 7, and 12 promoters was assessed by using the reporter gen udiA
gene. The ZmBGlu2 and 5 promoters were found to maintain a similar expression
to that of 35S CaMV promoter in the development stage studied and in the
conditions of the co-cultivation. Under the same transitory transformation protocole,
it was possible to produce the MAP85 antigen of Mycobacterium avium susp
paratuberculosis. | es_MX |
dc.documento.subject | Maíz; Glucosil hidrolasas; Promotores de expresión; Familia multigénica; proteína heteróloga | es_MX |