Análisis de la variación y la estructura genética de la centolla (Lithodes santolla, Molina, 1782) en la Región de Magallanes y Antártica Chilena, mediante marcadores moleculares.
Resumen
La centolla (Lithodes santolla) constituye uno de los grupos de mayor relevancia entre los crustáceos decápodos que habitan en aguas australes, en donde presenta un alto valor comercial. La pesquería de esta especie en Chile, está centrada en la Región de Magallanes y Antártica Chilena, donde se inició su extracción en 1928 y en la actualidad de acuerdo a las estadísticas registradas por el Instituto de Fomento Pesquera, existe una sobreexplotación del recurso, pero a pesar de ello no ha sido atendida bajo una mirada integral de auto sustentabilidad y la información sobre los diversos procesos genéticos de este organismo es limitada; por tal motivo el gobierno chileno regional ha impulsado la realización de investigaciones dirigidas hacia la generación de conocimiento sobre el estado biológico-pesquero y genético y está fomentando las iniciativas de cultivo en la Región de Magallanes y Antártica Chilena. Con el fin de aportar conocimiento genético de esta especie, en este estudio se planteó como objetivo principal evaluar y analizar la variación y estructura genética de la centolla en toda la Región de Magallanes y Antártica Chilena, mediante marcadores mitocondriales específicos, para lo cual se realizó una secuenciación de nueva generación (NGS, por sus siglas en ingles) de L. santolla mediante un secuenciador Illumina HiSeq, utilizando muestras de músculo de 10 machos y 10 hembras, seguida de un análisis bioinformático del genoma mitocondrial completo para diseñar primers para 9 genes mitocondriales (12S, 16S, 18S, COI, COII, COIII, NADH-1, NADH-3 y Región Control). Se colectaron organismos de centolla en toda el área de la Región de Magallanes y Antártica Chilena, mediante una embarcación artesanal centollera bajo un track de investigación y como parte de la planeación para realizar este estudio, la región se dividió en doce zonas de Norte a Sur. Los parámetros estimados para evaluar los niveles de variación genética fueron: número de haplotipos (h), diversidad haplotipica (H) y diversidad nucleotídica (π). La estructura genética se determinó mediante el cálculo de los índices de fijación Fst de Wright y el análisis de varianza molecular (AMOVA). Para estimar el aislamiento por distancia se utilizó la prueba de Mantel. Los resultados indicaron que la diversidad genética medida mediante los genes mitocondriales se encontró dentro del rango observado para otras especies de crustáceos decápodos, presentando valores altos. Los análisis de estructuración poblacional revelaron que no existe diferenciación genética y no se encontró una estructura de aislamiento por distancia; Sin embargo, la alta diversidad genética contenida en algunas de las zonas del Norte y del Sur de la Región de Magallanes y Antártica Chilena, convierte estas regiones en lugares potenciales para la conservación y diseño de futuros planes de manejo genético para la especie.