dc.contributor.advisor | López Martínez, Juana | es_MX |
dc.contributor.advisor | Hernández Saavedra, Norma Y. | es_MX |
dc.contributor.author | González Ochoa, Oscar Armando | es_MX |
dc.date.issued | 2010 | es_MX |
dc.identifier.uri | http://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/413 | |
dc.description.abstract | Existen limitados estudios de diversidad poblacional fenotípica o genotípica de las especies
que conforman la Fauna de Acompañamiento del camarón (FAC) en el Golfo de California.
El presente trabajo evaluó la existencia de estructura poblacional y genética del pargo
lunarejo Lutjanus guttatus y el chupalodo Porichthys analis a partir de muestras
provenientes de la FAC y de la pesca ribereña. El pargo lunarejo no presentó características
poblacionales diferentes y la relación Longitud-Peso (P = 0.000092 LE3.0509; LE, longitud
estándar) mostró un crecimiento isométrico. Se construyeron distribuciones de frecuencia
de tallas y mediante ELEFAN I se estimaron los parámetros de crecimiento de von
Bertalanffy, que fueron L∞= 515 mm (LE) y K= 0.13 e indican una especie longeva (23
años). La mortalidad natural (M = 0.35) se estimó con las ecuaciones empírica de Pauly y
de Ralston, y la mortalidad total (Z = 1.0) con la ecuación de curva de captura convertida
en tallas. El patrón de reclutamiento se estimó mediante ELEFAN II y se extendió durante
todo el año, con máximos en primavera-verano. La talla de primera captura (LC50= 80 mm,
LE) se estimó por ajuste no lineal de mínimos cuadrados. La proporción sexual fue 1:1. En
el chupalodo tampoco existen elementos para inferir una estructura poblacional. La relación
talla-peso fue P = 000092 LE3.0509; los parámetros de crecimiento L∞ = 352 mm de LE y K
= 0.5 indican una especie de moderadamente longeva (12 años). La mortalidad natural (M
= 0,97) y la total (Z = 4,67) aparecen altas. El patrón de reclutamiento es mayor durante
primavera-verano. La proporción sexual M:F fue 1,65:1 y la talla de primera madurez
(Lm50) es menor en el norte (148 mm LE) que en el centro y sur (184 mm LE; global, 157
mm LE) y en ambos casos mayor que la talla de primera captura (LC50 = 135 mm LE).
Se obtuvo ADN total que se usó como templado en la amplificación del gen 16S ADNmt (≈
iv
467 pb) mediante PCR, se secuenciaron y alinearon mediante Clustal W o Muscle, y
obtuvieron 33 haplotipos para el pargo lunarejo y 39 para el chupalodo. Se evaluaron las
relaciones de similitud y filogenia mediante la construcción de árboles con los criterios de
Vecino mas Cercano (Neigbbour-Joining), Máxima Parsimonia con el programa MEGA y
Máxima Verosimilitud mediante el programa BOSQUE. Debido a la alta consistencia (> 90
%), en la formación de dos clados dentro cada especie, a los altos valores de distancia
genética entre ellos (Pargo lunarejo, DNei, = 2.85; chupalodo DNei, = 6.0) y a niveles de
diferenciación poblacional, estimados mediante AMOVA, entre esos clados (Pargo
lunarejo: FCT =0.88, P = 0.000; Chupalodo: FCT = 0.91, P = 0.1461) se consideró que existe
una mezcla de dos especies (Lutjanus sp A y B) en lo que se consideró como pargo lunarejo
y al menos dos (Porihthys sp. A y B) en el chupalodo. Siendo un gen relativamente
conservado, los valores de diversidad genética como número de sitios polimorficos (S),
diversidad haplotipica (H), diferencias pareadas promedio (k) diversidad nucleotídica (π)
son relativamente bajos. De manera similar el resultado de un AMOVA utilizando este
marcador (16 S) no detecta una estructura genética significativa entre las localidades o
entre agrupaciones de éstas. El efecto de la sobrepesca sería evidente a mas largo plazo en
el pargo lunarejo que en el chupalodo, y si bien la pesca captura organismos jóvenes, la
veda del camarón coincide con los meses mas intensos de reproducción y reclutamiento de
ambas especies. Se sugiere el uso de otros marcadores como COI, Cit b para discriminar
adecuadamente entre las especies y Región control o microsatélites para discriminar
estructura poblacional. | es_MX |
dc.language.iso | es | es_MX |
dc.publisher | Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | es_MX |
dc.title | Estructura poblacional y genética del pargo lunarejo Lutjanus guttatus y del chupalodo Porichthys analis (Pisces) Presentes en la fauna de acompañamiento del camarón en el Golfo de California | es_MX |
dc.documento.id | cibnor.2010.gonzalez_o | es_MX |
dc.documento.indice | gonzalez_o | es_MX |
dc.documento.inst | cibnor | es_MX |
dc.dirtesis.grado | Doctorado en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales | es_MX |
dc.dirtesis.disciplina | Pesquerías | es_MX |
dc.dirtesis.universidad | Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | es_MX |
dc.dirtesis.facultad | Posgrado en Recursos Naturales | es_MX |
dc.documento.fecha | Abril, 2010 | es_MX |
dc.description.abstracten | There are limited studies on population phenotypic or genotypic diversity on fish species
that make up the Shrimp bycatch (FAC) in the Gulf of California (GC). The present study
evaluated the existence of population structure and genetic structure of spotted rose snapper
Lutjanus guttatus and darkedge midshipman fish Porichthys analis from shrimp bycathed
and artisanal fishery samples in the GC. The spotted rose snapper did not show a population
structure and length-weight relationship (W = 0.000092 SL3.0509, SL, standard length) was
estimated by least squares. Frequency distributions were constructed by ELEFAN I, size
and growth parameters of von Bertalanffy model were L ∞ = 515 mm (LE) and K = 0.13
indicating a long-lived species (23 years). Natural mortality (M = 0.35) was estimated using
Pauly´s empirical and Ralston´s equations, and total mortality (Z = 1.0) with length
converted catch curve equation. The recruitment pattern was estimated by ELEFAN II and
was extended throughout the year, with peaks in spring and summer. The mean size at
capture (LC50 = 80 mm, SL) was estimated by nonlinear least squares. The sex ratio M:F
was 1:1. Elements to infer a population structure in darkedge midshipman were not found
either. The length-weight relationship was W = 000,092 SL3.0509, the growth parameters L ∞
= 352 mm SL and K = 0.5 indicates a short life span (12 years). Natural (M = 0.97) and
total mortality (Z = 4.67) were high. The recruitment pattern is highest during spring and
summer. The sex ratio M: F was 1,65:1 and mean size at first maturity (Lm50) is lower in
the north (148 mm SL) than in the center and southern (184 mm SL; overall, 157 mm SL)
part of the Gulf and in both cases greater than the mean size at capture (LC50 = 135 mm
SL). For both species total DNA was obtained and used as template in PCR amplification
of 16S mtDNA (≈ 467 pb), the amplicons were sequenced and aligned by Clustal W or
vi
Muscle program, yielding 33 haplotypes for spotted rose snapper and 39 for darkedge
midshipman. We evaluated the homology relationships between haplotypes by Neighbor-
Joining, Maximum Parsimony (MEGA program) and Maximum Likelihood (BOSQUE
program) trees. Due to high consistency (> 90%) in two clades formation within each
species, the high values of genetic distance between them (snapper DNei = 2.85;
midshipman DNei = 6.0) and levels of population differentiation, estimated by AMOVA,
among these clades (snapper Lutjanus: FCT = 0.88, P = 0.000; midshipman Porichthys: FCT
= 0.91, P = 0.1461) we considered there is an admixture of two species (Lutjanus sp A and
B) in what initialy was considered as spotted rose snapper, and at least two species
(Porichthys sp. A and B) in the darkedge midshipman fish group. Because 16S is a
relatively conserved gene, the genetic diversity values as number of polymorphic sites (S),
haplotype diversity (H), average pairwise differences (k), nucleotide diversity (π) values
are relatively low. Similarly, the AMOVA result of using this marker (16S) did not detect a
significant genetic structure between populations or between clusters of them. The effect of
overfishing would be evident in a longer time in the spotted rose snapper Lutjanus than on
dakedge midshipman Porichthys, and even when shrimp fishery catches juvenil organisms,
the shrimp closed season coincides with the most intensive reproductive and recruitment
months from both species. We suggest the use of alternative markers such as COI, Cit b to
adequately discriminate between species and control region or microsatellites to
discriminate on population structure. | es_MX |
dc.documento.subject | Porichthys analis; Lutjanus guttatus; estructura | es_MX |