Mostrar el registro sencillo del ítem

dc.contributor.advisorHernández Saavedra, Norma Yolandaes_MX
dc.contributor.advisorScrosati, Ricardoes_MX
dc.contributor.authorMendoza Carrión, Gabrielaes_MX
dc.date.issued2003es_MX
dc.identifier.urihttp://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/40
dc.description.abstractSargassum lapazeanum es una macroalga parda endémica del golfo de California. Las especies del género Sargassum dominan la costa oriental de B.C.S. y resultan importantes en el ecosistema al proporcionar sustrato, refugio y alimento tanto a invertebrados como a peces. También tienen un amplio potencial de utilización para la obtención de alginatos, como fertilizante, forraje, o complemento alimenticio. Su sistema de reproducción es oogámico y monofásico con meiosis gamética y presentan vesículas de flotación o aerocistos. Estas características le confieren la capacidad de dispersar frondas reproductivas a grandes escalas y con ello la posibilidad de establecer intercambio de genes entre poblaciones. Un nivel de dispersión alto asociado a un flujo genético eventual pueden reflejarse en un aumento de la diversidad genética y una disminución de las diferencias genéticas entre las poblaciones. En este trabajo se evaluó la diversidad y estructura genética de S. lapazeanum a través de los polimorfismos de ADN amplificado mediante la técnica de la reacción en cadena de la polimerasa con oligonucleótidos aleatorios (PCR-RAPDs), con el fin de inferir sus posibles patrones de dispersión. Se realizaron colectas en tres sitios: Santa Rosalía (SR), Saladito (SAL) y rancho Piedras Coloradas (RPC) B.C.S. La estructura genética se estudió en tres escalas: regional, entre SR y los dos sitios dentro de la bahía de La Paz (SAL y RPC); local, entre SR, SAL y RPC; e intrapoblacional, entre los dos transectos de 40 m, separados por 20 m, a lo largo de los cuales se realizaron las colectas en cada sitio. Debido a que las macroalgas contienen grandes cantidades de polisacáridos y polifenoles, que dificultan la obtención de ADN, y a que este es el primer trabajo que analiza ADN en una especie mexicana de Sargassum, se llevó a cabo la implementación de un método específico para la extracción de ADN total de S. lapazeanum. Este método resultó sencillo, rápido y permitió obtener (mediante CTAB) ADN de buena calidad para RAPD, sin tratamientos de purificación como ultracentrifugación en gradiente de CsCl. Además, se analizaron tres métodos de preservación de frondas: en etanol, secadas en silica gel y congeladas, estas últimas resultaron más eficientes para la obtención de ADN y su amplificación por RAPD. También se optimizó la concentración de ADN (25 ng) y de dNTPs (0.6 mM) para la amplificación por PCR. Se probaron 25 oligonucleótidos de 10 pb, de los cuales dos fueron seleccionados para el análisis genético (OPAR06 y OPAR18). Se realizaron cálculos de la diversidad y la estructura genética con el “Tools for Population Genetics Analyses” (TFPGA), paquete que utiliza modelos especiales para la estimación de heterocigosidad con marcadores que solo revelan alelos dominantes como los RAPD. También se aplicaron el índice de diversidad de Shannon y un análisis de varianza molecular (AMOVA). A partir del registro de la presencia o la ausencia de bandas, se encontraron 105 loci (bandas polimórficas). La mayor diversidad genética se presentó dentro de la bahía de La Paz en RPC. Los resultados del índice de diversidad de Shannon y el AMOVA mostraron que la variabilidad genética dentro de transectos, localidades y regiones es mayor que entre los diferentes niveles (mayor que el 90% y menor al 10% respectivamente). El valor GST (análogo de FST, menor que 0.066) más alto correspondió al interior de los transectos. Esto concuerda con el valor theta (SS = 0.041), que indica una diferenciación genética significativa en la escala intrapoblacional. Sin embargo, los valores phiST (ST menor que 0.048; P menor que 0.02) señalan una estructura genética baja en todas las escalas consideradas, y por ende flujo genético limitado. La mayor distancia genética se encontró entre los transectos 1 de SR y SAL, mientras que la menor entre los dos transectos de SR. El análisis UPGMA colocó a SR como un grupo separado, pero relacionado con uno de los transectos tanto de SAL como de RPC, los cuales se combinaron entre sí. Estos resultados reafirman la ocurrencia de cierto flujo genético y por consiguiente la posible dispersión de S. lapazeanum en las escalas local y regional. Resultados similares se han reportado en otras macroalgas pardas, que como S. lapazeanum presentan aerocistos y se reproducen sexualmente.es_MX
dc.language.isoeses_MX
dc.publisherCentro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.es_MX
dc.titleEstructura genética de Sargassum lapazeanum (Sargassaceae: phaeophyceae) en escalas intrapoblacional, local y regional: Estimación de posibles patrones de dispersiónes_MX
dc.documento.idcibnor.2003.mendoza_ges_MX
dc.documento.indicemendoza_ges_MX
dc.documento.instcibnores_MX
dc.dirtesis.gradoMaestría en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturaleses_MX
dc.dirtesis.disciplinaBiología Marinaes_MX
dc.dirtesis.universidadCentro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.es_MX
dc.dirtesis.facultadPosgrado en Recursos Naturaleses_MX
dc.documento.fechaFebrero, 2003es_MX
dc.description.abstractenSargassum lapazeanum is a brown seaweed endemic to the Gulf of California. It dominates the east coast of Baja California Sur, together with other species of the Sargassum genus. They play a major ecological role providing food, substrate, and refuge for a great variety of invertebrates and fish. The amount of biomass is sufficient to offer Sargassum species for some biotechnological uses, principally as alginate gel, fertilizer, forage, and food supplementation for people and animals. S lapazeanum has an oogamic, monophasic mating system with gametic meiosis and floating vesicles or aerocysts. Thus there is potential for widespread dispersal through thalli (zygote-bearing) drift. Gene flow is the main gene interchange mechanism among populations, so greater genetic diversity and less population differentiation result from enhanced dispersal and eventual gene flow. In this work, the genetic diversity and structure of S. lapazeanum were evaluated through randomly-amplified polymorphic DNA (RAPD). To determine genetic structure on three scales, samples were collected at three sites in Baja California Sur (Santa Rosalía/SR, Saladito/SAL, and Rancho Piedras Coloradas/RPC). The regional scale was analyzed by comparing SR and bahía de La Paz/LP (SAL-RPC), the local scale was determined by comparing SR, SAL, and RPC, and the intra-populational scale was established by analyzing two 40 m transects separated by 20 m at each collection site. Due to high polysaccharides and polyphenols in brown seaweed and the lack of previous reports on S. lapazeanum DNA, a simple and rapid total DNA extraction procedure that yields good-quality DNA without purification step was developed in this work. Additionally, ethanol fixation, silica-drying, and -20°C freezing were evaluated as methods for seaweed frond preservation. We recommend -20°C freezing. The optimal DNA concentration for PCR was 25 ng, while the optimal amount of dNTPs was 0.6 mM. Genetic diversity and structure were calculated with the “Tools for Population Genetics Analyses” (TFPGA) software. The Shannon diversity index and molecular variance (AMOVA) were also calculated. From RAPD electrophoretic patterns, 105 loci or polymorphic bands were found. Shannon’s diversity index and AMOVA analyses showed that genetic variability of transects, localities, and regions were higher than that of the three scales combined (90% and 10%, respectively). The highest GST value (analogous to FST, 0.066) was found for transects. These results are consistent with theta value (SS = 0.041), which shows significant genetic differentiation at the intra-populational level. The phiST value (ST 0.048; P 0.02) indicates low genetic structure at all scales considered, and thus limited genetic flow. The greatest genetic distance was found between transect 1 of SR and that of SAL, while the least genetic distance was found between transects 1 and 2 of SR. UPGMA analysis revealed the SR site as a separate group, but related to transects of SAL and RPC, which were found to be combined. These results confirm the existence of genetic flow and, consequently, the possible dispersion of S. lapazeanum at local and regional scales. Similar results were reported for other seaweed that have aerocysts and sexual reproduction.es_MX
dc.documento.subjectSargassum lapazeanum; extracción ADN; RAPD; estructura genética; dispersiónes_MX


Ficheros en el ítem

Thumbnail

Este ítem aparece en la(s) siguiente(s) colección(ones)

  • Tesis Digitales CIBNOR
    Esta colección contiene texto completo de las tesis de Maestría y Doctorado del Programa de Posgrado del CIBNOR.

Mostrar el registro sencillo del ítem