dc.contributor.advisor | Castellanos Cervantes, Thelma Rosa | es_MX |
dc.contributor.author | Mora Ruiz, Merit del Rocío | es_MX |
dc.date.issued | 2010 | es_MX |
dc.identifier.uri | http://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/395 | |
dc.description.abstract | El trigo harinero (Triticum aestivum L.) es uno de los principales cultivos empleados para la alimentación a nivel mundial. Dentro de los factores abióticos el que más limita su rendimiento es la salinidad. Una fuente adicional de salinización y de aumento en los costos de producción es el uso indiscriminado de fertilizante nitrogenado. Por lo que el uso de variedades tolerantes a salinidad y el uso complementario de biofertilizantes, a base de Azospirillum brasilense, permitirá disminuir los efectos negativos de la salinidad, mejorar el rendimiento y disminuir los costos de producción durante su cultivo. Sin embargo, el efecto benéfico de Azospirillum como biofertilizante, a nivel de campo, ha mostrado ser inconsistente. La caracterización fenotípica de la adhesión de A. brasilense ha demostrado que es un proceso genotipo-dependiente (Adriana Rojas Hernández; Tesis de doctorado en desarrollo, U.A.S.; datos sin publicar). Y por tanto, se ha sugerido que las inconsistencias reportadas se deben a la incapacidad de A. brasilense de adherirse a cualquier genotipo. El presente trabajo se enfocó a estudiar si el fenotipo de adhesión de A. brasilense está correlacionado con una expresión diferencial de proteínas radiculares en trigos harineros y hexaploides sintéticos polimórficos a la adhesión de A. brasilense Cd, durante los primeros estadios de interacción planta-bacteria. Para esto, se analizaron los proteomas radiculares de los genotipos: Chinese spring (2n=42; AABBDD), Opata (2n=42; AABBDD), y el sintético hexaploide Norwich (2n=42; AABBDD). A los genotipos Opata y el sintético hexaploide se les adhiere A. brasilense mientras que al genotipo Chinese spring no. Plántulas de los tres genotipos fueron cultivadas hidropónicamente en cajas de Petri, irrigadas con medio Hoagland (media fuerza iónica) sin o con 150 mM NaCl, en condiciones controladas de luz y temperatura, durante 6 días. Al término de éste tiempo, se cosecharon las raíces para la extracción de proteínas solubles. Los extractos proteícos fueron resueltos por medio de electroforésis de isoelectroenfoque (1ª dimensión) seguida de electroforéis 2D SDS-PAGE. Proteínas con expresión diferencial fueron removidas del SDS-PAG y procesadas para determinar su secuencia vía el análisis MALDI TOF/TOF MS y MS/MS y así determinar su identidad. En ausencia de estrés salino, para el genotipo Chinese spring se detectaron dos proteínas reguladas a la alta (up-regulated = UR). El genotipo Norwich mostró dos proteínas UR y una regulada a la baja (down-regulated = DR). Y en el caso del genotipo Opata, se encontraron nueve proteínas UR. Solo un 42.1% de la secuencias obtenidas concordaron con secuencias conocidas. La identidad de éstas fue: una metionina adenosiltransferasa, una Gliceraldehido-3-fosfato-deshidrogenasa y dos malato deshidrogenasa en la variedad Opata, todas con un patrón de expresión UR. Mientras que para la variedad Norwich se identificó la proteína UDP-D-Gluroconato descarboxilasa (UR), una como malato deshidrogenas (UR), una HSP70 (DR) y una proteína hipotética (DR). La UDP-D-glucoronato descarboxilasa, Malato deshidrogenasa y la Gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa intervienen en el metabolismo de carbohidratos, lo que sugiere su participación en la estimulación de elongación celular y induciendo el crecimiento radicular. Mientras que la sobreexpresión de la metionina adenosiltransferasa podría estar ligada a la síntesis de la fitohormona etileno, lo que conllevaría un aumento en la producción de pelos radiculares. En condiciones de estrés salino se detectó una proteína UR en Chinese spring y para Opata una proteína UR y cinco proteínas DR De estas últimas ninguna secuencia concordó con las reportadas en las bases de datos consultadas. | es_MX |
dc.language.iso | es | es_MX |
dc.publisher | Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | es_MX |
dc.title | Expresión diferencial de proteínas radiculares de trigo (Triticum aestivum L.) a la adehsión de Azospirillum brasilense Cd | es_MX |
dc.documento.id | cibnor.2010.mora_m | es_MX |
dc.documento.indice | mora_m | es_MX |
dc.documento.inst | cibnor | es_MX |
dc.dirtesis.grado | Maestría en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales | es_MX |
dc.dirtesis.disciplina | Agricultura Sustentable | es_MX |
dc.dirtesis.universidad | Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | es_MX |
dc.dirtesis.facultad | Posgrado en Recursos Naturales | es_MX |
dc.documento.fecha | Noviembre, 2010 | es_MX |
dc.description.abstracten | Bread wheat (Triticum aestivum L.) is one of the main crops used for food worldwide. Among the abiotic factors that limits the performance is salinity. An additional source of salinity and increase in production costs is the indiscriminate use of nitrogen fertilizer. So, the use of salinity tolerant varieties and the complementary use of biofertilizers, Azospirillum brasilense-based, will reduce the negative effects of salinity, improve performance and reduce production costs for its cultivation. However, the beneficial effect of Azospirillum as biofertilizer, at field level has proven to be inconsistent. Phenotypic characterization of the adhesion of A. brasilense showed to be a genotype-dependent process (Adriana Rojas Hernández; PhD thesis, under develop UAS, unpublished data). And therefore, it has been suggested that inconsistencies could be associated to the failure of A. brasilense to adhere to any genotype. The present work is aimed to establish if the phenotype of adhesion of A. brasilense is correlated with root differential protein expression in bread wheat and synthetic hexaploid bread wheats and polymorphism to the adhesion of A. brasilense Cd, during the early stages of plant-bacteria interaction. We analyzed the root proteomes of Chinese Spring (2n = 42; AABBDD) Opata (2n = 42; AABBDD) and Norwich synthetic hexaploid (2n = 42; AABBDD) genotypes. A. brasilense adhere to genotypes Opata and Norwich while Chinese Spring genotype does no. Seedlings of the three genotypes were grown hydroponically in a Petri dish system, and were irrigated with half Hoagland solution without or with 150 mM NaCl, under controlled conditions of light and temperature for 6 days. At the end of this time, the roots were harvested for the extraction of soluble proteins. Protein extracts were resolved by isoelectric focusing electrophoresis (1st dimension) followed by 2D SDS-PAGE electrophoresis. Differentially expressed proteins were removed from the SDS-PAGE and processed to determine its sequence analysis via MALDI TOF / TOF MS and MS / MS to determine its identity. In the absence of salt stress, two proteins up-regulated (UR) were detected for Chinese spring genotype. The Norwich genotype showed two proteins UR and one down regulated (DR). In contrast the genotype Opata presented nine proteins UR. Only 42.1% of the sequences obtained were related with known sequences. The identity of these proteins was: one methionine adenosyltransferase, one glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase and two malate dehydrogenase in Opata, all UR. As for the variety Norwich, it was identified one UDP-D-Gluroconato decarboxylase (UR), one as malate dehydrogenase (UR), one as a HSP70 (DR) and one hypothetical protein (DR). UDP-D-glucuronate decarboxylase, malate dehydrogenase and glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase involved in the metabolism of carbohydrates, suggesting their rol in cell elongation and root growth. While overexpression of methionine adenosyltransferase could be linked to the synthesis of the phytohormone ethylene, which would cause an increase in the production of root hairs. Under salt stress, it was detected one Chinese spring and Opata one UR protein and five proteins DR None of the obtained sequence agreed with those reported in the databases searched. | es_MX |
dc.documento.subject | Trigo; A. brasilense Cd; proteínas. | es_MX |