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Estatus taxonómico y estructura genética poblacional del género Merluccius en el Pacífico Nororiental y Central, mediante la aplicación de marcadores mitocondriales y nucleares
dc.contributor.advisor | García de León, Francisco Javier | es_MX |
dc.contributor.author | Silva Segundo, Claudia Alicia | es_MX |
dc.date.issued | 2011 | es_MX |
dc.identifier.uri | http://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/344 | |
dc.description.abstract | En el Pacífico Nororiental y Central se han descrito cuatro morfo-tipos de merluzas: Merluccius productus, M. angustimanus, M. hernandezi y uno conocido como “merluza enana”. De estos morfo-tipos solo los dos primeros son considerados como especies válidas, no obstante, su delimitación taxonómica es confusa debido al alto traslape de los caracteres morfológicos diagnósticos y a la falta de una revisión exhaustiva de material biológico a lo largo de su distribución. Desde el punto de vista poblacional se han descrito hasta el momento cuatro stocks en la región del Pacífico Nororiental: dos localizados en aguas parcialmente aisladas (la Sonda de Puget y el Estrecho de Georgia), uno denominado stock “costero” genéticamente homogéneo y altamente migratorio a lo largo de las costas del Pacífico Nororiental y por último un stock denominado “enano” distribuido en el sur de Baja California. El objetivo del presente estudio fue investigar el estatus taxonómico y la estructura genética poblacional de las merluzas del Pacífico Nororiental y Central, empleando marcadores mitocondriales y microsatélites y un muestreo más exhaustivo a lo largo de la distribución geográfica en dicha región. Los sitios de muestreo fueron los siguientes: cinco ubicados en las costas de Estados Unidos de América (la Sonda de Puget, Washington, Oregón, Eureka y San Francisco), tres en las costas de México (Alto Golfo de California, Bahía Sebastián Vizcaíno y en la parte sureña del estado de Baja California Sur) y uno en Costa Rica. Se analizaron secuencias de tres genes mitocondriales (Citocromo b, Citocromo Oxidasa subunidad I y 16S ADN ribosómico) y diez loci microsatélites. Los índices de diversidad haplotípica y nucleotídica, las distancias genéticas y los análisis filogenéticos de los genes mitocondriales indicaron que los cuatro morfo-tipos representan en realidad una misma especie, la cual corresponde a M. productus. Además la variabilidad genética de los tres genes mitocondriales y diez loci microsatélites mostró altos niveles de diferenciación genética entre las merluzas que habitan en aguas parcialmente aisladas (la Sonda de Puget y el Alto Golfo de California) y las merluzas presentes en las costas abiertas del Pacífico Nororiental y Central (representantes del stock “costero”). En particular para el stock “costero”, no se habían detectado diferencias genéticas significativas entre poblaciones, sin embargo con los loci microsatélites se detectó una estructura de aislamiento por distancia relacionada con el patrón de migración de la especie. El origen de aislamiento genético observado entre la población costera y la del Alto Golfo de California de M. productus coincide con una invasión y posterior reducción del flujo genético durante el cierre de un corredor inter-peninsular en la región de La Paz, Baja California Sur que conectaba ambas regiones durante el pleistoceno tardío. Además, las pruebas de neutralidad y el análisis de desacuerdos o “mismatch” de los genes mitocondriales sugieren que la especie en forma global sufrió una expansión poblacional reciente durante el último periodo de glaciación. De manera particular, las merluzas del Alto Golfo de California, caracterizadas por tener un alto número de haplotipos únicos (exceso de polimorfismo de baja frecuencia), apoyan la idea que dicha área representó un refugio, por lo que se debe de considerar como un área prioritaria para la conservación. | es_MX |
dc.language.iso | es | es_MX |
dc.publisher | Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | es_MX |
dc.title | Estatus taxonómico y estructura genética poblacional del género Merluccius en el Pacífico Nororiental y Central, mediante la aplicación de marcadores mitocondriales y nucleares | es_MX |
dc.documento.id | cibnor.2011.silva_c | es_MX |
dc.documento.indice | silva_c | es_MX |
dc.documento.inst | cibnor | es_MX |
dc.dirtesis.grado | Doctorado en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales | es_MX |
dc.dirtesis.disciplina | Ecología | es_MX |
dc.dirtesis.universidad | Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | es_MX |
dc.dirtesis.facultad | Posgrado en Recursos Naturales | es_MX |
dc.documento.fecha | Agosto, 2011 | es_MX |
dc.description.abstracten | In the northeast and central Pacific four morphological types of hake have been described: Merluccius productus, M. angustimanus, M. hernandezi and one known as "dwarf hake". From these morphological types only the first two are considered valid species; however, their taxonomic delimitation is unclear due to the high overlap of diagnostic morphological characters and lack of a comprehensive review of biological material over its distribution. From a population point of view, until now only four stocks have described in the northeastern Pacific region: two located in waters partially isolated (the Puget Sound and the Strait of Georgia), another stock called "coastal" genetically homogeneous and highly migratory along the coasts of the northeast Pacific and finally a stock called "dwarf" distributed in southern Baja California. The aim of this study was to investigate the taxonomic status and population genetic structure of Pacific hake in the northeast and central Pacific, using mitochondrial and microsatellite markers and a more comprehensive sampling across the geographical distribution in the region. The collection sites were: five located on the shores of the United States of America (the Puget Sound, Washington, Oregon, Eureka and San Francisco), three off the coast of Mexico (Gulf of California, Bahía Sebastián Vizcaíno and the southern part of Baja California Sur) and one in Costa Rica. We analyzed sequences of three mitochondrial genes (Cytochrome b, Cytochrome Oxidase Subunit I and 16S ribosomal DNA) and ten microsatellite loci. The nucleotide and haplotype diversity, genetic distances and phylogenetic analysis of mitochondrial genes indicated that the four morpho-types actually represent the same species, which corresponds to M. productus. Also the genetic variability of the three mitochondrial genes and ten microsatellite loci showed high levels of genetic differentiation between hakes living in partially isolated waters (the Puget Sound and the Upper Gulf of California) and hake present in the open coasts of the Pacific Eastern and Central (representatives of the coastal stock). In prior studies, the coastal stock had not detected significant genetic differences between populations separated by several miles. However, with this study microsatellite loci did detect isolation by distance structure related to the migration pattern of the species. The origin of genetic isolation observed among the coastal population and the Upper Gulf of California, M. productus coincide with an invasion and subsequent reduction of gene flow during the closure of a waterway that was present in the region of La Paz, Baja California Sur connecting both regions during the Late Pleistocene. Moreover, neutrality tests and mismatch analysis of mitochondrial genes suggest that these populations have recently undergone a recent population expansion during the last period of glaciation. In particular, hake of the Upper Gulf of California is characterized by a high number of unique haplotypes (excess low-frequency polymorphisms) which supports the hypothesis that the area is a refuge for hake and therefore should be given priority consideration for conservation. | es_MX |
dc.documento.subject | merluza; ADN mitocondrial y microsatélites | es_MX |
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