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dc.contributor.advisorCruz Hernández, Pedroes_MX
dc.contributor.authorPérez Valencia, Laura Izascumes_MX
dc.date.issued2011es_MX
dc.identifier.urihttp://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/341
dc.description.abstractLa almeja de sifón Panopea globosa es un bivalvo sésil, cuya distribución abarca el Golfo de California hasta Bahía Magdalena. Debido a su alta rentabilidad, su pesca inició el año 2002, aún sin tener un conocimiento amplio sobre su biología. Para establecer un plan de manejo adecuado para la especie, es necesario saber si estamos tratando con una sola población o bien con varias de ellas. Con el objetivo de conocer los niveles actuales de diversidad genética y determinar si existe estructura genética poblacional se realizó un análisis basado en microsatélites. Primeramente se identificaron marcadores microsatélite específicos para la especie, mediante la construcción de 5 librerías genómicas enriquecidas, de las cuales se diseñaron 36 pares de cebadores obteniéndose dos marcadores polimórficos útiles. Se analizaron organismo colectados en 3 localidades del Golfo de California [San Felipe (SF), Puerto Peñasco (PP), Guaymas (GU)] y una localidad de la costa occidental de la península de Baja California Sur [Bahía Magdalena (BM)] . Se estimó la variabilidad genética expresada en, número de alelos (nA), número de alelos efectivos (ne), heterocigosidad observada (Ho), heterocigosidad esperada (He), riqueza alélica (AR) y coeficiente de endogamia (FIS). Se realizaron pruebas de Equilibrio de Hardy-Weinberg (EHW) y desequilibrio de ligamiento. Para detectar estructura genética poblacional se calcularon los valores pareados de FST y 3 Análisis Moleculares de Varianza, (AMOVA) con las siguientes jerarquías: Golfo de California vs Pacífico; PP-SF vs BM-GU y PP-SF vs BM vs GU. Se encontraron niveles moderados de variabilidad genética (nA=13.37, ne= 7.48, AR= 11.31, Ho=0.71, He= 0.87, FIS= 0.26). No se observó desequilibrio por ligamiento. No se observó EHW en la mayoría de las localidades, debido a déficit de heterocigotos, causado por alelos nulos. Se observaron diferencias genéticas significativas entre BM y las dos localidades del Alto Golfo, SF y PP (FST= 0.018, FST= 0.036, respectivamente). Ninguna de las comparaciones entre los grupos formados para el AMOVA mostró algún valor significativo, sin embargo BM, tiene una tendencia a ser una localidad distinta del resto. En el presente análisis preliminar con dos loci microsatélites, se concluye que los valores de variabilidad y estructura genética pueden estar sugiriendo que existe estructura genética poblacional, en donde BM es una población distinta a las del Alto Golfo de California, lo cual es explicado en base a los factores ambientales que influyen en la dispersión larval. Con el fin de realizar un análisis poblacional más robusto se recomienda ampliar el estudio con el uso de al menos seis loci microsatélites polimórficos adicionales.es_MX
dc.language.isoeses_MX
dc.publisherCentro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.es_MX
dc.titleVariabilidad genética de la almeja de sifón Panopea globosa (Dall, 1898) en el Noroeste de Méxicoes_MX
dc.documento.idcibnor.2011.perez_les_MX
dc.documento.indiceperez_les_MX
dc.documento.instcibnores_MX
dc.dirtesis.gradoMaestría en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturaleses_MX
dc.dirtesis.disciplinaBiología Marinaes_MX
dc.dirtesis.universidadCentro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.es_MX
dc.dirtesis.facultadPosgrado en Recursos Naturaleses_MX
dc.documento.fechaMarzo, 2011es_MX
dc.description.abstractenThe geoduck clam Panopea globosa is a sessile bivalve, whose distribution covers the Gulf of California to Bahia Magdalena. Due to its high profitability, fishery began in 2002, even without extensive knowledge about its biology. To establish an adequate management plan for the species, it is necessary to know whether we are dealing with a single population or several of them. With the goal of knowing the population genetic structure, specific microsatellite markers were identified, through the construction of 5 enriched genomic libraries. 36 pairs of primers were designed and only two yielded polymorphic markers. Samples from 3 location in the Gulf of California [San Felipe (SF), Puerto Peñasco (PP), Guaymas (GU)] and one from the Pacific [Bahia Magdalena (BM)] were analyzed. We estimated the genetic variability expressed in number of alleles (nA), number of effective alleles (ne), observed heterozygosity (Ho), expected heterozygosity (He), allelic richness (AR) and inbreeding coefficient (FIS). Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) and linkage disequilibrium were tested as well. To detect population genetic structure FST paired values were calculated and three Analysis Molecular of Variance, AMOVA (Gulf of California vs Pacific PP-SF vs BM-GU, PP-SF vs GU vs BM). We found moderate levels of genetic variability (nA = 13.37, ne = 7.48, AR = 11.31, Ho = 0.71, He = 0.87, FIS = 0.26). Linkage disequilibrium was not observed. Deviation to HWE was observed due to heterozygote deficiencies, caused by null alleles in most locations. Significant genetic differences were observed between BM and the two localities of the Upper Gulf, SF and PP (FST = 0.018, FST = 0.036, respectively). None of the comparisons between the groups formed for the AMOVA showed any significant F value, however BM has a tendency to be a different location from the rest. In this analysis approach with two microsatellite loci, we conclude that the values of variability suggested population genetic structure, where BM is a distinct population of the Upper Gulf of California, probably due to environmental factors influencing larval dispersal. To make a more robust population analysis is recommended to extend the study to at least six additional polymorphic microsatellite loci.es_MX
dc.documento.subjectPanopea globosa; genetic variability; genetic structure; microsatelliteses_MX


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  • Tesis Digitales CIBNOR
    Esta colección contiene texto completo de las tesis de Maestría y Doctorado del Programa de Posgrado del CIBNOR.

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