Genómica poblacional del bacalao negro Anoplopoma fimbria (Pallas, 1814): rol de la heterogeneidad del paisaje y la variación ambiental en la determinación de la estructura poblacional de un pez de profundidad

Abstract

"La comprensión de los patrones de conectividad y los procesos evolutivos en especies marinas migratorias es esencial para su gestión, pero presenta desafíos significativos. Aunque las especies pueden mostrar una aparente panmixia (homogeneidad genética) a gran escala, las presiones ambientales locales pueden generar una sutil diferenciación adaptativa, que es crucial para la persistencia y productividad de la especie. El presente estudio se centró en el Bacalao Negro (Anoplopoma fimbria), un pez demersal y migratorio de alto valor comercial en el Pacífico Norte, con el objetivo principal de evaluar y contrastar su estructura genética y adaptativa de la especie e identificar los posibles factores ambientales relacionados. Para superar las limitaciones de los marcadores tradicionales, el presente trabajo integró secuencias de ADN mitocondrial de la región control (N = 124 secuencias) y microsatélites (N = 11 loci), para establecer la estructura neutral e histórica y la secuenciación de genoma completo de baja cobertura (LcWGR) (N = 61 individuos), para la evaluación a escala genómica de la conectividad y la selección. Además, empleamos modelos de distribución de especies para contextualizar los posibles factores ambientales de la estructura. Los resultados revelaron una compleja arquitectura genética en el bacalao negro (Anoplopoma fimbria) a lo largo del Pacífico Norte, caracterizada por una conectividad genética a gran escala (panmixia) que coexiste con una fuerte estructura adaptativa a nivel local. Los diferentes marcadores moleculares empleados (ADN mitocondrial, microsatélites y SNPs del genoma completo) ofrecen visiones complementarias y discordantes, reflejando distintos procesos y escalas temporales evolutivas. El ADN mitocondrial apuntó a una divergencia antigua entre las poblaciones del Pacífico occidental y oriental, posiblemente originada en refugios glaciales mientras que los microsatélites, sugieren una diferenciación contemporánea, aislando a la población al sur de la distribución. Sin embargo, los datos del genoma completo no replicaron esta estructura, el mapeo de los loci microsatélites en el genoma reveló que seis de once estaban en regiones codificantes, por lo que la diferenciación observada con estos marcadores probablemente refleja una variación funcional bajo selección, en lugar de una deriva neutral. Los datos del genoma revelaron loci específicos bajo una fuerte presión selectiva que apuntan a una adaptación poligénica..."