Diversidad genética del coral Pseudodiploria strigosa en el Caribe mexicano

Abstract

"Los arrecifes de coral del Caribe Mexicano están en crisis debido a múltiples amenazas persistentes a las que se enfrentan. Una de las amenazas más recientes es la pérdida de tejido de corales pétreos (SCTLD). Dentro de las especies más afectadas se encuentra Pseudodiploria strigosa, especie de gran importancia ecológica al ser un coral perteneciente al orden de los escleractinios (formadores de arrecifes). Es de vital importancia integrar estudios genéticos para conservar el potencial adaptativo y evolutivo de las especies ante el cambio climático y enfermedades emergentes. Desafortunadamente no existen suficientes estudios en el Caribe mexicano que detallen la dinámica poblacional de la especie, así como su conectividad y diversidad genética, lo que dificulta dichas acciones de conservación. Debido a la forma de reproducción de Pseudodiploria strigosa y su alto potencial de dispersión se espera que exista una alta diversidad genética en la zona de estudio. El objetivo del estudio se centró en evaluar la diversidad genética en diferentes localidades del Caribe mexicano mediante el uso de las herramientas moleculares y la aplicación de técnicas de secuenciación utilizando polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs), marcadores mitocondriales y nucleares. Se analizaron muestras de tejido de Pseudodiploria strigosa de 146 colonias diferentes. Se elaboraron las librerías genómicas para ser enviados a secuenciar por medio de Ilumina y también se llevó a cabo la secuenciación Sanger para poder observar la diversidad genética por medio de la diversidad haplotípica y nucleotídica. Aunque se obtuvo un catálogo de 463,043 loci, no se encontraron loci compartidos entre las localidades o entre colonias dentro de las localidades al momento de filtrar por localidades e individuos. Para el marcador Pax-C se detectaron 24 haplotipos únicos, y elevada diversidad haplotípica Hd = 0.764±0.04 y baja diversidad nucleotídica p = 0.0064±0.0007. El marcador MaSC1 se obtuvieron 22 haplotipos únicos y una mayor diversidad haplotípica Hd = 0.918±0.02 y baja diversidad nucleotídica p = 0.0088±0.0007. Estos valores se han observado en poblaciones que han experimentado un estrechamiento del número de individuos seguido por un posterior crecimiento poblacional. Este trabajo es pionero en la generación del conocimiento genético de la especie."