Identificación de la batería básica de proteínas involucradas en la formación de la concha de moluscos gasterópodos y bivalvos
Abstract
"Los moluscos poseen una concha calcárea sólida con excepcionales propiedades ópticas, mecánicas, magnéticas, osteogénicas y osteoinductivas, muy atractivas para ciencias como la biomedicina. La biomineralización de estos organismos es un proceso de deposición de materia inorgánica controlado por una compleja matriz orgánica (proteínas, quitina y polisacáridos). Las proteínas de la matriz son los principales reguladores de este proceso (nucleación, crecimiento, polimorfismos) y hasta la fecha, no se ha descrito una batería básica de proteínas encargada de la biomineralización de los moluscos. Sin embargo, la presencia de diferentes microestructuras en las capas nacarada y prismática en las clases de moluscos más estudiadas (por ejemplo: nácar columnar en gasterópodos y en forma de placas en bivalvos), sugiere la presencia de una batería básica taxón-específica. El objetivo de este trabajo es identificar la batería básica de proteínas que intervienen en la formación de concha de los moluscos, bivalvos y gasterópodos. Para ello, se creó una base de datos con proteínas de la matriz orgánica de diferentes especies de bivalvos y gasterópodos, las cuales fueron caracterizadas mediante herramientas bioinformáticas y agrupadas utilizando diagramas de Venn y diagramas de cuerdas. Así mismo, se hicieron cladogramas con las proteínas con mayor representatividad de las bases de datos. Las bases de datos fueron conformadas por cerca de 1,500 proteínas, de 32 especies de gasterópodos y 37 de bivalvos, de las cuales numerosas proteínas presentaron modificaciones postraduccionales; sugiriendo que las proteínas son extracelulares y migran al sitio de formación de la concha. No se logró esclarecer una posible batería básica de proteínas de la concha para molulscos, sin embargo, se econtró que existen dominios comunes contenidos en las secuencias de las proteínas de la concha de bivalvos y gasterópodos, siendo los dominios más representativos C1q, Carbonic anhydrase, ChtBD2, EGF, KU y vWA, además del motivo Coiled coil region y Efh y las regiones de baja complejidad (LCR) y las regiones transmembranales (TR). No se determinó la relación entre las proteínas de la concha con la microestructura de su concha debido a la falta de información existente."