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Delineación molecular de especies de Pocillopora (Lamarck, 1816) utilizando marcadores mitocondriales y nucleares recuperados de librerías transcriptómicas

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Texto completo PDF:
Tesis de maestría de Francisco José Gutiérrez Gutiérrez (1.658Mb)
Fecha
2022
Autor
Gutiérrez Gutiérrez, Francisco José
Metadatos
Mostrar el registro completo del ítem
Resumen
"La incorporación de tecnologías de secuenciación de alto rendimiento (HTS) al estudio de la biodiversidad de sistemas arrecifales ha propiciado el uso del concepto filogenético de especie como un paradigma predominante en la descripción de nuevos grupos taxonómicos. Particularmente en géneros como Pocillopora, cuyas características morfológicas no son consistentes con la historia evolutiva propuesta por distintos marcadores moleculares, resulta indispensable un análisis genético comparativo de marcadores tradicionales con los desarrollados a partir de análisis filogenómico. El objetivo del presente trabajo fue comparar el número de especies resultantes de análisis filogenético, análisis de delimitación de especies de un solo locus y análisis de redes haplotípicas de los marcadores mt AT6-ORF y HSP70, con las especies resultantes de análisis filogenéticos, de componentes principales y ancestría individual de SNPs derivados de exones exclusivos de corales escleractíneos. Se encontró una discordancia mito-nuclear, en la cual el número de especies resultantes para las 46 librerías RNA-Seq mediante el análisis a priori del marcador mitocondrial AT6-ORF fueron seis, y mediante SNPs bialélicos derivados de exones cuatro especies. Los resultados concuerdan con aproximaciones recientes en las cuales tanto el uso de loci individuales, o cientos de loci nucleares compartidos entre individuos, rechazan las hipótesis de monofilia recíproca entre linajes evolutivos propuestas mediante análisis del mitogenoma. Futuros estudios que indaguen en el proceso de especiación mediante herramientas genómicas podrán corroborar si esta discordancia corresponde o no a eventos de contacto secundario entre especies con barreras reproductivas incipientes. "
URI Nacional
https://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/2658
URI
http://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/3121
Colecciones
  • Tesis de Maestría

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