ANÁLISIS COMPARATIVO DE LAS SECUENCIAS DE PROMOTORES DE LA FAMILIA DE FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN DOF EN MAÍZ
Abstract
"Uno de los principales mecanismos por los cuales un organismo sufre cambios fenotípicos es la modificación en las secuencias de ADN encargadas de regular la expresión de genes. Durante el proceso de domesticación del maíz, la mano del hombre influyó en la selección de genes y secuencias de promotores que han sido conservados y que pueden estar relacionados a la adaptabilidad de las plantas a diferentes condiciones. Por eso, es necesario identificar qué elementos regulatorios han sido conservados entre variedades silvestres y actuales. En el presente trabajo realizamos un análisis comparativo de las secuencias de promotores que regulan la expresión de la familia de factores de transcripción Dof en Maíz. Para eso, seleccionamos al ancestro silvestre del maíz actual, el Teosinte, a la raza ancestral de Palomero Toluqueño y a un maíz actual, B73. Se determinó la arquitectura de los promotores Dof y se identificaron los elementos regulatorios presentes a lo largo de las secuencias. También, se realizó un análisis de expresión del gen Dof01 de maíz Palomero bajo condiciones de estrés por temperatura baja y alta (4°C y 42°C, respectivamente), comparando los resultados contra datos de expresión de maíz B73 dispuestos en bases de datos. En ellas identificamos los elementos regulatorios cis responsables de la arquitectura del promotor, a qué familias de factores de transcripción pertenecen y los perfiles de expresión espacio-temporal de los mismos. Realizamos un análisis de correlación para identificar los factores de transcripción que regulan la expresión del gen Dof01. El análisis de secuencias mostró que hay un elemento de inserción/deleción de 179 pb que está presente en el promotor Dof01 de B73, pero ausente en las secuencias de las otras dos variedades. Además, identificamos los elementos regulatorios cis que pueden estar relacionados a la respuesta a bajas temperaturas. El análisis comparativo de las secuencias del promotor Dof01 mostró que los elementos regulatorios están altamente conservados. Sin embargo, algunos sitios de unión a factores de transcripción presentes en el promotor de Teosinte no se encuentran en B73 y viceversa. Por otra parte, los datos de expresión del gen Dof01 de PAL muestran una sobreexpresión con respecto al control debido a la respuesta a frío, mientras que los datos de expresión del gen Dof01 de B73 muestran que este gen se reprime con respecto al control..."