METAGENOMA ASOCIADO A ÁREAS HOSPITALARIAS: IDENTIFICACIÓN DE BACTERIAS CAUSANTES DE INFECCIONES NOSOCOMIALES Y GENES DE RESISTENCIA A ANTIMICROBIANOS EN PACIENTES DE TERAPIA INTENSIVA
Resumen
"Las infecciones asociadas a la atención de la salud (IAAS), están relacionadas con una elevada morbilidad, mortalidad y un gasto económico importante debido a la sobre estancia hospitalaria que estás generan. Además, el uso generalizado e indiscriminado de antimicrobianos en el tratamiento de estas infecciones promueve la selección y permanencia de cepas multidrogo resistentes (MDR) que eventualmente pueden emerger o distribuirse en las unidades hospitalarias. El objetivo de este estudio fue determinar la diversidad de la comunidad bacteriana en el área hospitalaria, así como identificar las bacterias causantes de infecciones nosocomiales en pacientes de las unidades de cuidados intensivos neonatales (UCIN), y cuidados intensivos adultos (UCI), apoyado en el desarrollo, estandarización y validación de una técnica de diagnóstico rápido. Para ello, se realizó la validación analítica y clínica de 15 pruebas diagnósticas basadas en la amplificación isotérmica de ácidos nucleicos (LAMP, por sus siglas en inglés) con 192 cultivos aislados a partir de muestras biológicas de pacientes con infecciones nosocomiales en UCIN y UCI, del HGZ1 IMSS de B.C.S. Se desarrollaron, estandarización y validaron cuatro pruebas para la identificación de: Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aureus, así como 11 pruebas para identificar los genes involucrados en el mecanismo de resistencia a antimicrobianos; Clase A β-lactamasas (ESBL): blaTEM, blaSHV, blaKPC, clase B β-lactamasas: blaIMP, blaVIM, blaNDM, Clase D β-lactamasas: blaOXA-23-like , blaOXA-24-like , blaOXA-51-like , blaOXA-58-like y mecA de S. aureus resistente a meticilina. Encontrando que la sensibilidad, especificidad, Valor Predictivo Positivo (VPP) y Valor Predictivo Negativo (VPN) de las pruebas diagnósticas es del 100%, en comparación con el equipo automatizado Vitek 2 y la técnica de PCR punto final. Además, se determinó que la extensa resistencia a β-lactamicos en UCI es causada por la producción de β-lactamasas de amplio espectro (ESBL) mediada principalmente por blaTEM y blaSHV en A. baumannii, K. pneumoniae y P. aeruginosa. De esta manera, la aplicación de las técnicas de diagnóstico representan una alternativa para su uso rutinario en las instituciones de salud, favoreciendo el acertado y oportuno diagnóstico de las infecciones nosocomiales..."