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Expresión diferencial de proteínas en juveniles de ostión japonés Crassostrea gigas expuestos a organismos del género Prorocentrum spp.

dc.contributorNORMA YOLANDA HERNANDEZ SAAVEDRA
dc.creatorMIGUEL ANGEL MATUS HERNANDEZ
dc.date2013-03
dc.identifierhttp://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/1558
dc.identifier.urihttp://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/2919
dc.description"Las especies del género Prorocentrum se encuentran ampliamente distribuidas a lo largo del Pacífico y el Golfo de California, existiendo una alta probabilidad de que sean ingeridas por diversas especies filtradoras, dentro de las que se encuentra el ostión japonés Crassostrea gigas, afectando su crecimiento, supervivencia y reproducción. Por lo tanto, en este estudio se pretende caracterizar la respuesta fisiológica de C. gigas ante este estresor, mediante la identificación y evaluación de los cambios en los patrones de expresión de proteínas mediante electroforesis bidimensional (2-DE). Juveniles de ostión japonés C. gigas (5-7 mm) fueron expuestos a células completas (1200, 2400, 3600, 4800 y 6000 cel mL-1) de Prorocentrum lima, Prorocentrum minimum y Prorocentrum rhathymum, e independientemente a diversas diluciones de extractos acuosos y orgánicos obtenidos de las mismas especies (1:50, 1:100 y 1:200). Mediante un análisis comparativo de los mapas proteómicos generados a partir 2-DE, se detectaron cambios en la expresión de algunas proteínas, obteniéndose un patrón electroforético con 434 proteínas en homogenados de organismos expuestos a células completas, de los cuales 26 presentaron diferencias significativas en la expresión. En los homogenados de organismos expuestos a extractos acuosos se detectaron un total de 476 proteínas, observándose diferencias significativas en siete, y finalmente, en los extractos de organismos expuestos a extractos orgánicos se detectaron 623 proteínas, encontrándose diferencias significativas en 13. Para el análisis de espectrometría de masas se seleccionaron los puntos de proteína que presentaron una expresión diferencial con respecto al control, encontrándose que cada uno de los puntos peptídicos correspondió a diferentes proteínas. En los organismos expuestos a 6,000 cel mL-1 se seleccionaron cuatro puntos de proteínas, de los cuales 3 presentaron una disminución en la expresión y 1 sobre expresión con cada una de las cepas; identificándose un total de siete proteínas: Proteína Toll de interacción; Dihidropteridina reductasa, Proteína secretora rica en cisteina LCCL dominio 2, Periostina, Catepsina L, Tropomiosina y cadena ligera esencial de miosina; en los extractos acuosos se seleccionó un punto de proteína sobre-expresado con P. lima, y disminuida su expresión con P. mínimum y P. rhathymum identificándose 4 posibles proteínas..."
dc.description"Species of the genus Prorocentrum are found widely distributed along the Pacific and the Gulf of California with a high probability of being ingested by various filtering species affecting their growth, survival and reproduction. One of these species is the Japanese oyster Crassostrea gigas. Therefore, this study intends to characterize C. gigas physiological response to this stressor by identifying and assessing changes in protein expression patterns by bidimensional electrophoresis (2-DE). Juvenile Japanese oysters C. gigas (5-7 mm) were exposed to whole cells (1200, 2400, 3600, 4800, and 6000 cells mL-1) of Prorocentrum lima, Prorocentrum minimum, and Prorocentrum rhathymum, and independently at various dilutions of aqueous and organic extracts obtained from the same species (1:50, 1:100 and 1:200). Through a comparative analysis of proteomic maps generated from 2-DE, changes were detected in some protein expressions; we obtained an electrophoretic pattern with 434 spots in the organism homogenates exposed to whole cells, of which 26 showed significant expression differences. In the homogenates exposed to aqueous extracts a total of 476 spots were detected; significant differences were observed in seven of them; finally, 623 spots were detected in the extracts of those exposed to organic extracts, finding significant differences in 13 of them. For the mass spectrometric analysis we selected the protein spots that showed a differential expression with respect to control. The results showed that each one of the peptide points corresponded to different proteins. Four protein spots were selected from the organisms exposed to 6.000 cells mL-1, of which three showed a down-regulated and one up-regulated expressions with each one of the strains. We identified a total of seven proteins: Toll-interacting protein, Dihydropteridine reductase, Cysteine-rich secretory protein LCCL domain-containing 2, Periostin, Tropomyosin, and myosin essential light chain. From the aqueous extracts, we selected one up-regulated protein spot with P. lima and one down-regulated with P. minimum and P. rhathymum, identifying four possible proteins..."
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherCentro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/AUTOR/C. gigas, Prorocentrum, proteínas, electroforesis bidimensional (2-DE)
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/AUTOR/Proteins, bidimensional electrophoresis (2-DE)
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/2
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/24
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/2403
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/230227
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/230227
dc.titleExpresión diferencial de proteínas en juveniles de ostión japonés Crassostrea gigas expuestos a organismos del género Prorocentrum spp.
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersion


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matus_m TESIS.pdf
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Description:
Tesis de Miguel Ángel Matus ...
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