Desarrollo y evaluación de métodos moleculares para la detección e identificación de dinoflagelados tóxicos y nocivos en las costas de México

Abstract

En las costas mexicanas, no existe un programa formalmente establecido de monitoreo de eventos de Floraciones Algales Nocivas (FAN). El objetivo de este estudio fue el desarrollar métodos moleculares basados en marcadores ribosomales para la rápida identificación de especies FAN con la finalidad de mejorar las actividades de monitoreo en las costas de México. Para el análisis de comunidades, se probaron las técnicas CE‐SSCP y HRM. En el caso de CE‐SSCP, el fragmento 28S LSU D7 presentó la mejor resolución para separar nueve especies de dinoflagelados. Sin embargo, para discriminar especies del género Prorocentrum se observó una baja resolución a nivel de especie con HMR, encontrándose el agrupamiento de las especies del género únicamente con en base a los hábitos que comparten, es decir: especies bentónicas y planctónicas. Los resultados obtenidos en este trabajo sugieren que los métodos CE‐SSCP y HRM pueden ser utilizados como una primera aproximación para conocer la composición de dinoflagelados en muestras ambientales, no obstante, se recomienda realizar pruebas de especificidad adicionales. Para la identificación específica de especies del género Prorocentrum, se utilizaron dos aproximaciones: métodos de hibridación en los formatos de microarreglo y células completas (WC‐FISH) y PCR. Desafortunadamente, después de una detallada estandarización de estas metodologías, no se obtuvo la suficiente resolución para discriminar entre especies del género Prorocentrum cercanamente relacionadas. Finalmente, se evaluaron los límites de las especies mediante la integración de análisis morfológico y molecular para las especies P. belizeanum y P. hoffmannianum. Las sutiles diferencias morfológicas encontradas, nos permiten concluir que P. hoffmannianum y P. belizeanum son conespecíficas. Los datos moleculares no separan a estos organismos como dos morfoespecies, por lo tanto pueden ser consideradas como el complejo de especies Prorocentrum hoffmannianum, los cuales se encuentran filogenéticamente separados en clados en base a su origen geográfico.