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Producción de metano en ambientes hipersalinos: diversidad microbiana, estructura y función de la comunidad de arqueas metanógenas
| dc.contributor.advisor | López Cortés, Alejandro | es_MX |
| dc.contributor.author | García Maldonado, José Quinatzin | es_MX |
| dc.date.issued | 2014 | es_MX |
| dc.identifier.uri | http://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/279 | |
| dc.description.abstract | La producción biológica de metano ha sido bien documentada en comunidades microbianas de ambientes hipersalinos. Sin embargo, poco es conocido a cerca de la diversidad filogenética de arqueas productoras de metano, capaces de realizar su metabolismo energético bajo condiciones altas de salinidad y sulfatos. Actualmente existen varios linajes de arqueas metanógenas (AM) que carecen de miembros cultivables o aislados, indicando que aún existe grupos por elucidar dentro de estos linajes filogenéticos. En el presente estudio se caracterizó la composición de la comunidad de AM en tapetes microbianos de cinco distintos ambientes hipersalinos de Baja California Sur, México. Se encontraron dos nuevos linajes de secuencias del gen mcrA, correspondiendo con AM putativamente hidrogenotróficas. Análisis filogenéticos mostraron que son diferentes de organismos cultivables, pero relacionados con AM estrictamente hidrogenotróficas del Orden Methanomicrobiales. Su contribución al funcionamiento del ecosistema fue detectada a través de la cuantificación de transcritos del gen mcrA de muestras naturales. Incrementos de producción de metano en condiciones bajas de salinidad y sulfatos, también sugieren la presencia de AM hidrogenotróficas. Sin embargo, análisis de clonas del mcrA y de patrones de bandas de DGGE de secuencias del 16S ARNr y mcrA, revelaron que la comunidad de AM estuvo dominada por miembros metilotróficos del género Methanohalophilus. A través de herramientas moleculares y geoquímicas, se mostró que la limitación de sustrato y valores de salinidad y sulfatos mayores de 3% y 25mM respectivamente, pueden ser considerados como potenciales limitantes ambientales para la metanogénesis en los sitios estudiados. Este estudio provee nueva información a cerca de AM no cultivables y no previamente descritas de ambientes hipersalinos, cuyos papeles ecológicos y evolutivos no han sido claramente comprendidos. | es_MX |
| dc.language.iso | es | es_MX |
| dc.publisher | Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | es_MX |
| dc.title | Producción de metano en ambientes hipersalinos: diversidad microbiana, estructura y función de la comunidad de arqueas metanógenas | es_MX |
| dc.documento.id | cibnor.2014.garcia_j | es_MX |
| dc.documento.indice | garcia_j | es_MX |
| dc.documento.inst | cibnor | es_MX |
| dc.dirtesis.grado | Doctorado en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales | es_MX |
| dc.dirtesis.disciplina | Biotecnología | es_MX |
| dc.dirtesis.universidad | Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | es_MX |
| dc.dirtesis.facultad | Posgrado en Recursos Naturales | es_MX |
| dc.documento.fecha | Enero, 2014 | es_MX |
| dc.description.abstracten | Biological methane production has been well documented at microbial communities from hypersaline environments. However, little is know about phylogenetic diversity of methanogenic archaea capable of perform their energetic metabolisms under conditions of high salinity and sulfate. Currently, there are several strains of methanogenic archaea (MA) lacking of cultivable or isolated members, indicating that there are yet methanogenic groups for elucidating inside of these phylogenetic lineages. In this study we characterized the community composition of MA in microbial mats from five different hypersaline environments in Baja California Sur, Mexico. Two new lineages of mcrA sequences corresponding with putative hydrogenotrophic methanogens were found. Phylogenetic analysis showed to be different to cultivable organisms, but related with strictly hydrogenotrophic Ma of the order Methanomicrobiales. Their contribution to the function of the system was detected through the quantification of mcrA transcript in natural samples. Increases in methane production under low conditions of salinity and sulfate, also suggest the presence of hydrogenotrophic MA in nature, however clone library analysis of mcra sequences and DGGE band patterns of 16S rRNA and mcrA sequences revealed that the MA community is was dominated by methylotrophic members of the genus Methanohalophilus. Through molecular and geochemical approaches, we showed that substrate limitation and salinity and sulfate values higher than 3% and 25mM, respectively, could be considered as potential environmental constraints for methanogenesis in the studied sites. This study provide information about uncultivable and non previously described MA for hypersaline environments, which ecological and evolutionary role have not been clearly understood. | es_MX |
| dc.documento.subject | Arqueas metanógenas; tapetes microbianos hipersalinos; Baja California Sur; mcrA | es_MX |
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