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Evaluación de la expresión diferencial de genes involucrados en el reconocimiento y adhesión de Azospirillum spp. a raíz de trigo

dc.contributorTHELMA ROSA CASTELLANOS CERVANTES
dc.creatorANA CAROLINA MARTINEZ SALIDO
dc.date2017-11
dc.identifierhttp://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/769
dc.identifier.urihttp://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/2670
dc.description"Uno de los cereales cultivados más importantes a nivel mundial es el trigo, el cual aporta una quinta parte del total de las calorías consumidas por el hombre. No obstante, los requerimientos de fertilizantes químicos para la producción del grano de trigo son elevados y su constante uso genera problemas de contaminación medioambiental. Una estrategia para mitigar este problema es el uso de rizobacterias promotoras de crecimiento (PGPR, por sus siglas en inglés) ya que presentan un alto potencial para ser usados como inoculantes. Azospirillum brasilense, perteneciente a las PGPR, es una de las bacterias mayormente estudiadas y, se ha demostrado, en experimentos en laboratorio, sus beneficios en el crecimiento y desarrollo del trigo. Sin embargo, los resultados en campo son inconsistentes. La caracterización fenotípica de adhesión, llevada a cabo por el grupo del laboratorio, sugieren que A. brasilense Cd se adhiere preferencialmente a ciertos genotipos de trigo. Indicios de esta afinidad se ha obtenido de la caracterización fenotípica realizada en una población para mapeo genético constituida de 114 líneas haploide dobladas (DH), derivadas de los progenitores Triticum aestivum L. cv. Ópata y el sintético hexaploide WSHD67.2, de las cuales el 32% presentaron el fenotipo de adhesión, cuyos loci de caracteres cuantitativos (QTL por sus siglas en inglés) se localizaron en regiones de los cromosomas 1A, 2D, 6B y 5A. Adicionalmente, estudios de proteoma de la raíz inoculada con A. brasilense Cd mostró expresión diferencial de algunas proteínas. En este trabajo, se probaron otras especies del género de Azospirillum, además de A. brasilense Cd, como A. brasilense SP245, A lipoferum y A. halopraeferans en trigos harineros y sintéticos. Se determinó que existe diferencias significativas de adhesión a raíz y por lo tanto, un polimorfismo cuando A. brasilense SP245 y A. lipoferum son inoculados. Para identificar los genes involucrados en la adhesión y reconocimiento planta-bacteria, se analizó la expresión global de genes mediante el uso de microarreglos. En este análisis, se encontraron 81 genes reprimidos, y 165 genes inducidos en el sistema radicular de la variedad Ópata en presencia de A brasilense Cd. .."
dc.description"Worldwide, wheat is one the most important crops and contributes a fifth of the total calories consumed by humans. However, the requirements of chemical fertilizers for the production of wheat grain are high, and its constant application generates environmental pollution problems. Thus, the plant growth promoting rhizobacteria or PGPR have a potential use as an inoculant and a candidate to lower chemical fertilizer consumption. Azospirillum brasilense is the bacteria mostly studied in the last decade, which demonstrated its benefits, undoubtedly at least for in vitro experiments, for the growth and development of wheat. However, the results in the field are inconsistent. The phenotypic characterization of bacteria adhesion trait carried out by the group of the laboratory suggested that Azospirillum brasilense Cd adhered preferentially to certain genotypes of wheat. Evidence of this affinity has been obtained from the phenotype characterization of this trait on a wheat mapping population consisting of 114 doubled haploid lines, derived from progenitors Triticum aestivum L. cv. Ópata genotype and the synthetic hexaploid WSHD67.2, where 32% of the lines presented the adhesion trait. Also, quantitive trait loci (QTL) associated with chromosomes 1A, 2B, 6B, and 5A pointed out that this trait is allele-dependent. Furthermore, proteomic studies in wheat roots inoculated with A. brasilense Cd showed differential protein expression on those bacteria-adhering genotypes. In this work, phenotypic adhesion trait was tested, in addition to A. brasilense Cd, with A. brasilense SP245, A. halopraeferans, and A. lipoferum, in a collection of bread and synthetics hexaploids wheat. It was found adhesion polymorphism when A. brasilense SP245 and A. lipoferum were inoculated. It was analyzed the global transcription of genes through the use of a microarray assay to identify genes involved in the adhesión and recognition of wheat-Azospirillum interaction. A total of 165 sub-expressed and 81 genes over-expressed founded in cultivar Ópata roots in the presence of A. brasilense Cd..."
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherCentro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/AUTOR/PGPR, Azospirillum, trigo, expresión de genes
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/2
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/24
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/2417
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/241714
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/241714
dc.titleEvaluación de la expresión diferencial de genes involucrados en el reconocimiento y adhesión de Azospirillum spp. a raíz de trigo
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersion


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