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Estructura genética de Sargassum lapazeanum (Sargassaceae: phaeophyceae) en escalas intrapoblacional, local y regional: Estimación de posibles patrones de dispersión

dc.contributorNORMA YOLANDA HERNANDEZ SAAVEDRA
dc.contributorRicardo Augusto Scrosati
dc.creatorGABRIELA MENDOZA CARRION
dc.date2003-02
dc.identifierhttp://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/501
dc.identifier.urihttp://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/2653
dc.description"Sargassum lapazeanum es una macroalga parda endémica del Golfo de California. Las especies del género Sargassum dominan la costa oriental de B.C.S. y resultan importantes en el ecosistema al proporcionar sustrato, refugio y alimento tanto a invertebrados como a peces. También tienen un amplio potencial de utilización para la obtención de alginatos, como fertilizante, forraje, o complemento alimenticio. Su sistema de reproducción es oogámico y monofásico con meiosis gamética y presentan vesículas de flotación o aerocistos. Estas características le confieren la capacidad de dispersar frondas reproductivas a grandes escalas y con ello la posibilidad de establecer intercambio de genes entre poblaciones. Un nivel de dispersión alto asociado a un flujo genético eventual pueden reflejarse en un aumento de la diversidad genética y una disminución de las diferencias genéticas entre las poblaciones. En este trabajo se evaluó la diversidad y estructura genética de S. lapazeanum a través de los polimorfismos de ADN amplificado mediante la técnica de la reacción en cadena de la polimerasa con oligonucleótidos aleatorios (PCR-RAPDs), con el fin de inferir sus posibles patrones de dispersión. Se realizaron colectas en tres sitios: Santa Rosalía (SR), Saladito (SAL) y rancho Piedras Coloradas (RPC) B.C.S. La estructura genética se estudió en tres escalas: regional, entre SR y los dos sitios dentro de la bahía de La Paz (SAL y RPC); local, entre SR, SAL y RPC; e intrapoblacional, entre los dos transectos de 40 m, separados por 20 m, a lo largo de los cuales se realizaron las colectas en cada sitio. Debido a que las macroalgas contienen grandes cantidades de polisacáridos y polifenoles, que dificultan la obtención de ADN, y a que este es el primer trabajo que analiza ADN en una especie mexicana de Sargassum, se llevó a cabo la implementación de un método específico para la extracción de ADN total de S. lapazeanum. Este método resultó sencillo, rápido y permitió obtener (mediante CTAB) ADN de buena calidad para RAPD, sin tratamientos de purificación como ultracentrifugación en gradiente de CsCl. Además, se analizaron tres métodos de preservación de frondas: en etanol, secadas en silica gel y congeladas, estas últimas resultaron más eficientes para la obtención de ADN y su amplificación por RAPD..."
dc.description"Sargassum lapazeanum is a brown seaweed endemic to the Gulf of California. It dominates the east coast of Baja California Sur, together with other species of the Sargassum genus. They play a major ecological role providing food, substrate, and refuge for a great variety of invertebrates and fish. The amount of biomass is sufficient to offer Sargassum species for some biotechnological uses, principally as alginate gel, fertilizer, forage, and food supplementation for people and animals. S lapazeanum has an oogamic, monophasic mating system with gametic meiosis and floating vesicles or aerocysts. Thus there is potential for widespread dispersal through thalli (zygote-bearing) drift. Gene flow is the main gene interchange mechanism among populations, so greater genetic diversity and less population differentiation result from enhanced dispersal and eventual gene flow. In this work, the genetic diversity and structure of S. lapazeanum were evaluated through randomly-amplified polymorphic DNA (RAPD). To determine genetic structure on three scales, samples were collected at three sites in Baja California Sur (Santa Rosalía/SR, Saladito/SAL, and Rancho Piedras Coloradas/RPC). The regional scale was analyzed by comparing SR and bahía de La Paz/LP (SAL-RPC), the local scale was determined by comparing SR, SAL, and RPC, and the intra-populational scale was established by analyzing two 40 m transects separated by 20 m at each collection site. Due to high polysaccharides and polyphenols in brown seaweed and the lack of previous reports on S. lapazeanum DNA, a simple and rapid total DNA extraction procedure that yields good-quality DNA without purification step was developed in this work. Additionally, ethanol fixation, silica-drying, and -20°C freezing were evaluated as methods for seaweed frond preservation. We recommend -20°C freezing. The optimal DNA concentration for PCR was 25 ng, while the optimal amount of dNTPs was 0.6 mM. Genetic diversity and structure were calculated with the “Tools for Population Genetics Analyses” (TFPGA) software. The Shannon diversity index and molecular variance (AMOVA) were also calculated. From RAPD electrophoretic patterns, 105 loci or polymorphic bands were found ..."
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherCentro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/AUTOR/Sargassum lapazeanum, extracción ADN, RAPD, estructura genética, dispersión
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/AUTOR/DNA extraction, RAPD, genetic structure
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/2
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/24
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/2417
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/241707
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/241707
dc.titleEstructura genética de Sargassum lapazeanum (Sargassaceae: phaeophyceae) en escalas intrapoblacional, local y regional: Estimación de posibles patrones de dispersión
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersion


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