"En los ríos de alta montaña de la Sierra Madre Occidental (SMO) habita una diversidad de salmónidos ampliamente desconocida para la ciencia, a todo el complejo se les denomina truchas mexicanas y pertenecen al género Oncorhynchus. En México sólo existen dos especies formalmente descritas, una denominada O. mykiss nelsoni que se distribuye en la Sierra de San Pedro Mártir en Baja California y la otra llamada O. chrysogaster típica de las cuencas Fuerte, Sinaloa y Culiacán de la SMO. Para la mayoría de las especies sin describir existe escasa información que permita la delimitación de las mismas, una situación preocupante ya que este complejo de especies se encuentra bajo una inminente amenaza de extinción debido a la degradación del hábitat, el cambio climático global y la introducción de especies exóticas, en particular el cultivo de truchas arcoíris (O. mykiss) que se practica sin control en el área de distribución de las truchas nativas. En este trabajo se analizó la diversidad genética de las truchas nativas del Noroeste de México mediante 11 marcadores microsatélites con el objetivo de determinar unidades taxonómicas que coadyuven a la delimitación de las especies, así mismo se evaluó el nivel de impacto e introgresión genética de las truchas exóticas que se emplea en el cultivo. Los parámetros de diversidad genética en el complejo de truchas nativas arrojaron 24 alelos promedio por locus. Los valores de riqueza alélica oscilaron entre 1.707 y 4.8. La heterocigocidad observada se encontró en un rango de 0.085-0.7234. Se observó un total de 70 alelos exclusivos en las distintas poblaciones de truchas distribuidas en las diferentes cuencas. Empleando distancias genéticas de Cavalli-Sforza y Edward y árboles filogenéticos mediante el método del vecino más cercano, se detectó los siguientes grupos genéticamente homogéneos: Guzmán/Yaqui-Bavispe, Yaqui-Sirupa/Mayo, Conchos, San Lorenzo/Piaxtla, Acaponeta/Baluarte/Presidio, un grupo en el arroyo La Sidra de la cuenca del San Lorenzo y un grupo en el Arroyo Aparique de la cuenca del Fuerte. Así mismo todos estos grupos fueron distintos genéticamente de las truchas formalmente descritas (O. mykiss nelsoni y O. chrysogaster) así como de las truchas arcoíris exóticas que se cultivan en la zona. Dicha agrupación fue corroborada por diversos análisis; de asignación mediante un método bayesiano, estimación de flujo genético y un análisis de varianza molecular (AMOVA).""In the mountain creeks and rivers of the northern part of the Sierra Madre Occidental (SMO) in Mexico, there is a high diversity of native salmonids, all commonly recognized as Mexican trout, members of the genus Oncorhynchus. In Mexico there are jus two species formally described one of them called O. mykiss nelsoni which inhabits the Sierra San Pedro Martir in Baja California, the second one recognized as O. chrysogaster from the rives Fuerte, Culiacan and Sinaloa in the SMO, but most of the species remain undescribed and with low information that allows their delimitation. Also this species complex in under an impending treat of extinction due to habitat degradation, global climate change, and the introduction of exotic species mainly the rainbow trout (O. mykiss) which are cultivated in almost all the rivers where the natives inhabit without a good control. In this paper the genetic diversity of the native trout from northwestern Mexico was analyzed using 11 microsatellite loci with the aim to determine taxonomic units that contribute to the species delimitation as well as assess the impact and genetic introgretion due to exotic rainbow trout. The genetic biodiversity parameters show 24 average alleles per locus, allelic richness values between 1.707 and 4.8, the observed heterozigocity was in a range from 0.085 to 0.7234, also a total of 70 exclusive alleles were distributed in the different basins. The construction of a phylogenetic neighbor-joining tree was made base on Cavalli-Sforza and Edward´s genetic distances which indicated the formation of the follow genetically homogeneous groups: Guzmán/Yaqui-Bavispe, Yaqui-Sirupa/Mayo, Conchos, San Lorenzo/Piaxtla, Acaponeta/Baluarte/Presidio, one group in the Sidra stream from San Lorenzo basin and one more group in the Aparique stream belonging to the Fuerte basin, also these groups were genetically different to the formally described trout (O. mykiss nelsoni and O. chrysogaster) just as the exotic rainbow trout. This grouping was corroborated by the assignation analysis using the Bayesian method, the gene flow estimation, and the analysis of molecular variance (AMOVA) which revealed the highest variance between group (63.94%), a 31.76% corresponding to population between groups and the last 4.40% of variance between populations inside of groups."