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Marcadores moleculares para la identificación de la sardina del Pacífico (Sardinops sagax caeruleus)

dc.contributorNORMA YOLANDA HERNANDEZ SAAVEDRA
dc.creatorIGNACIO LEYVA VALENCIA
dc.date2003-04-10
dc.identifierhttp://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/379
dc.identifier.urihttp://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/2596
dc.descriptionEn México, la sardina del Pacífico nororiental (Sardinops sagax caeruleus) ha aportado más del 40% de la captura total nacional y más del 90% específicamente en el Golfo de California. La identificación de “stocks” y el conocimiento de su estructura, así como otros factores biológicos y ecológicos, son esenciales para desarrollar planes de manejo de los recursos pesqueros. La sistemática de este grupo se ha basado en gran medida en caracteres morfológicos, no obstante, algunas especies tropicales y subtropicales de clupeidos pueden ser difíciles de identificar, e incluso puede requerirse el empleo de microscópio y personal especializado. En el presente trabajo se analizó la aplicación de electroforésis de isoelectroenfoque (IEF) en cristalinas y de marcadores moleculares (de las subunidades ribosomales 12S y 16S), diseñados a partir de secuencias reportadas en S. s. melanostictus, como una alternativa para la identificación rápida y confiable de muestras de tejido y productos de desove de sardina monterrey (S. s. caeruleus). Los análisis de cristalinas mediante IEF, permitieron la identificación rápida a nivel de especie, sin embargo, con esta técnica no es posible discriminar entre stocks y su aplicación estaría limitada al análisis de juveniles y adultos. Por otra parte, los oligonucleótidos probados en este trabajo para ambas subunidades ribosomales (12S y 16S) permitieron la amplificación de secuencias parciales específicas, cuya homología fue casi idéntica entre las muestras de sardina monterrey y sardina japonesa. Además, se obtuvo un porcentaje de homología de 82% con otras familias, esta diferencia es suficiente para delimitar especies dentro de la familia Clupeidae con un alto grado de confianza. Aunque no fué posible probar ambos marcadores en muestras de huevos y larvas de S.s.caeruleus, los resultados obtenidos permiten visualizar un panorama positivo en la búsqueda de una estrategia para identificar de manera rápida y confiable muestras de productos de desove. Las secuencias obtenidas en este trabajo, representan el primer registro de secuencias de las subunidades ribosomales menor (12S) y mayor (16S) en la sardina del Pacífico (S. s. caeruleus) y la sardina crinuda (Ophistonema libertate).
dc.descriptionIn Mexico, the Pacific sardine (Sardinops sagax caeruleus) contributed more than 40% of the capture in the Pacific and more than 90% in the Gulf of California. Identification of "stocks" and knowledge of its structure, as well as other biological and ecological factors, are essential for developing plans to handle this fishing resource. The taxonomy of this group has been based, to a great extent, on morphologic characteristics. Some clupeid species, with tropical and subtropical distribution, can be difficult to identify, and it may require the use of microscopy and specialized personnel. In this work, an isoelectric focusing technique (IEF) of ocular lens proteins (cristallines) and molecular markers (small 12S and large 16S ribosomal subunits) designed from sequences reported in S. s. melanostictus, an alternative for fast and reliable identification of tissue samples, eggs, and larvae of the monterrey sardine (S. s. caeruleus). The analyses of lens proteins by means of IEF allowed quick identification at species level. This technique does not discriminate between stocks, and its application would be limited to analyses of juveniles and adults. Oligonucleotides of ribosomal subunits (12S and 16S) allowed the amplification of specific partial sequences, whose homology was almost 100% between sardine samples (monterrey and japanese sardines). Additionally, homology of 82% with other genera was obtained, making possible the delimitation of species within the same genus, with a high degree of confidence. Although it was not possible to prove both markers in egg and larvae samples of S. s. caeruleus, the results obtained allow us to visualize a strategy to quickly and reliably identify egg and larvae samples. The sequences obtained in this work represent the first record of sequences of the small (12S) and large (16S) ribosomal subunits in the Pacific sardine (S. s. caeruleus) and crinuda sardine (Ophistonema libertate).
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherCentro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/AUTOR/Sardina del Pacífico; secuencias ribosomales; identificación de especies
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/6
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/31
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/3105
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/310504
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/310504
dc.titleMarcadores moleculares para la identificación de la sardina del Pacífico (Sardinops sagax caeruleus)
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion


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