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Análisis de las comunidades microbianas de tapetes laminados de los ambientes hipersalinos de Laguna San Ignacio y Guerrero Negro Baja California Sur, México

dc.contributorALEJANDRO LOPEZ CORTES
dc.creatorYOSSEF LOPEZ DE LOS SANTOS
dc.date2008-08-29
dc.identifierhttp://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/295
dc.identifier.urihttp://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/2556
dc.descriptionSe caracterizaron independientemente las comunidades de cianobacterias y bacterias de nueve tapetes microbianos laminados, de los ambientes hipersalinos intermareales e inundados permanentemente de Laguna San Ignacio y Guerrero Negro, Baja California Sur, México. A partir de la extracción de ADN total se obtuvo huellas genéticas de las comunidades microbiológicas, por electrofóresis en gel con gradiente desnaturalizante (DGGE) para el gen de 16S ARNr, usando la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) con primers específicos para cada grupo. Se estimó la riqueza (OTUs) y diversidad (indice de Shannon-Wiener), utilizando los perfiles electroforéticos obtenidos por DGGE. Se caracterizó parcialmente la macro-estructura de los tapetes laminados y se desarrolló el análisis de agrupación con la ayuda del coeficiente de similitud de “DICE” y el método UPGMA para comparar las comunidades de cianobacterias y bacterias de los primeros 20 mm de la laminación. No se registraron diferencias significativas (p > 0.05) en la riqueza para las comunidades de cianobacterias de Laguna San Ignacio y Guerrero Negro. Las comunidades bacterianas de Laguna San Ignacio registraron una mayor riqueza y diversidad que las comunidades de Guerrero Negro. La estructura de las comunidades microbiológicas presentaron una clara heterogeneidad, con un valor >3.4% de similitud (de acuerdo a UPGMA y el coeficiente de similitud DICE) para el grupo de las cianobacterias y >9.2% para las comunidades bacterianas. Los resultados obtenidos, sugieren la ausencia de relación entre la riqueza, diversidad y la estructura de la comunidad de cianobacterias respecto la macro-estructura de los tapetes laminados.
dc.descriptionIn this study, the cyanobacterial and bacterial communities were independently characterized, as well as their spatial variability in nine distinct laminated microbial mats from intertidal and permanently flooded hypersaline environments of Laguna San Ignacio and Guerrero Negro, Baja California Sur, México. The diversity of 16S rRNA genes from microorganisms was investigated by total DNA extraction from mat samples and community fingerprints obtained via denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) using polymerase chain reaction (PCR) with specific primers for each group. We estimated richness (OTUs) and diversity (Shannon-Wiener index), using DGGE electrophoresis profiles. A partial macro-structure characterization from the microbial mats was made and a cluster analysis was performed with DICE coefficient and the UPGMA method in order to compare the different microbial communities of cyanobacteria and bacteria from the first 20 mm from the laminated mat. No significant (p>0.05) differences in richness and diversity between cyanobacterial communities from Laguna San Ignacio and Guerrero Negro were found. The structure of cyanobacterial communities showed to be heterogeneous, with a value of >3.4% similarity (according to the WPGMA analysis and DICE coefficient), with clear shifts in community structure in all nine mats. The structure of bacterial communities also showed a clear heterogeneity with a value of >9.2%. These results suggest the absence of relation among the macro-structure, richness, diversity and community structure of cyanobacterial populations.
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherCentro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/AUTOR/Diversidad microbiana; PCR-DGGE; tapetes microbianos
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/2
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/24
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/2414
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/241404
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/241404
dc.titleAnálisis de las comunidades microbianas de tapetes laminados de los ambientes hipersalinos de Laguna San Ignacio y Guerrero Negro Baja California Sur, México
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesis


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