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Diseño de métodos moleculares para el análisis de fitoplancton tóxico y nocivo

dc.contributorNORMA YOLANDA HERNANDEZ SAAVEDRA
dc.creatorANGELICA HERRERA SEPULVEDA
dc.date2008-12-08
dc.identifierhttp://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/289
dc.identifier.urihttp://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/2549
dc.descriptionLa relevancia del estudio de los florecimientos algales nocivos (FAN), deriva del aumento registrado en el número y frecuencia de dichos eventos en las diferentes zonas costeras del océano mundial. Dentro de este contexto, se han enfocado esfuerzos al establecimiento de sistemas de monitoreo ambiental y biológico en diferentes países, tanto para estudiar las relaciones entre variabilidad ambiental y la presencia y peligrosidad de eventos, como para desarrollar una capacidad predictiva que permita la toma oportuna de medidas preventivas y correctivas. Aún cuando la frecuencia con que se presentan estos eventos en aguas mexicanas va en aumento, en nuestro país los estudios para eficientar el monitoreo biológico y ambiental no ha sido adecuadamente atendido. El método clásico para la detección y enumeración de especies formadoras de FAN, es la observación directa de material vivo o fijado, mediante microscopia de luz. Sin embargo, este proceso es tedioso y lento, y requiere de taxónomos expertos. Para resolver estos problemas, en los últimos años se ha incrementado la atención de la comunidad científica en el uso y desarrollo de técnicas moleculares basadas principalmente en el ADN ribosomal. Como primera fase, se obtuvieron secuencias nucleótidicas de 12 especies de dinoflagelados pertenecientes a los órdenes Gonyaulacales (Alexandrium affine, Alexandrium margaleffi, Gonyaulax spinifera, G. turbiney y Lingulodinium polyedrum, Prorocentrales (Prorocentrum mexicanum, P. minimun y P. lima) y Gymnodiniales (Akashiwo sanguinea, Gymnodinium catenatum -2 variedades- y Cochlodinium polykrikoides); empleando cebadores para dos niveles de especificidad taxonomica (dominio Eukarya y clase Dynophyceae), que flanquean regiones codificantes (Subunidad pequeña SSU, Subunidad grande LSU y 5.8S) y no codificantes (Secuencias intertranscritas ITS1 e ITS2) del ADNr. Las secuencias obtenidas, se confrontaron con las bases de datos mundiales mediante, para determinar, excluir o confirmar la especie, según el caso. Con los cebadores que flanquean la región SSU-ITS-LSU, se confirmó 1 especie (C. polykrikoides), mientras que se generaron 54 nuevos registros, para Akashiwo sanguinea, Gymnodinium catenatum -2 variedades, A. margaleffi, A. affine, G. spinifera, G. turbiney, L. polyedrum, P. lima, P. minimun, y P. mexicanum [...]
dc.descriptionThe relevance of Harmful algae blooms (HAB) study is that one of the must important aspect in the phytoplanktonic study, derivates of the increasing number and frequency of this events through the costal ocean. In this context, it has focus in the establishment of biological and environmental monitoring programs in different countries, the objective is generate information about the relation between environmental parameters and the present and danger of this events, and to develop a predictive capacity, that permits to take preventive and corrective actions. Although the increasing in the frequency of this event presents in Mexican waters, at the time, in our country the studies to improve the biological and environmental monitoring program have been inadequate. The classical approach for detecting and enumerating phytoplankton species is the direct observation by light microscopy of live or preserved material, however, it is considered to be tedious, time-consuming and requiring an appropriate level of experience/expertise in phytoplankton identification. To solve these problems, attention has increasingly focused on molecular techniques that use genetic markers like ribosomal DNA. In this study, we obtained nucleotide sequence of twelve culture species of dinoflagellates which belong to the order Gonyaulacales (Alexandrium affine, Alexandrium margaleffi, Gonyaulax spinifera, G. turbiney y Lingulodinium polyedrum, Prorocentrales (Prorocentrum mexicanum, P. minimun y P. lima) y Gymnodiniales (Akashiwo sanguinea, Gymnodinium catenatum -2 variety- y Cochlodinium polykrikoides); with universal primers for two levels of taxonomic specificity (domain Eukarya and class Dynophyceae), targeting coding (Small SSU 18S, partial large subunit LSU, 5.8S) and noncoding (Internal transcribed spacer ITS1 and ITS2) parts of the rDNA. The nucleotide sequence, were submitted in worldwide bases, to determine, exclude o confirm the species. With the primers which target SSU-ITS-LSU region, we confirm one specie (C. polykrikoides), 54 new sequences were generated in the case of Akashiwo sanguinea, Gymnodinium catenatum -2 varieties, A. margaleffi, A. affine, G. spinifera, G. turbiney, L. polyedrum, P. lima, P. minimun, y P. mexicanum [...]
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherCentro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/AUTOR/Fitoplancton toxico y nocivo; métodos moleculares; ADNr
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/2
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/24
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/2417
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/241707
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/241707
dc.titleDiseño de métodos moleculares para el análisis de fitoplancton tóxico y nocivo
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesis


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