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Análisis de la estructura genética poblacional del dorado (Coryphaena hippurus; linnaeus, 1758) en el noroeste del pacífico mexicano y Golfo de California mediante el uso de microsatélites.

dc.contributorPEDRO CRUZ HERNANDEZ
dc.creatorMIGUEL ÁNGEL TRIPP VALDEZ
dc.date2009-08-28
dc.identifierhttp://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/274
dc.identifier.urihttp://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/2534
dc.descriptionEl dorado Coryphaena hippurus es un pez pelágico altamente migratorio que en México está reservado exclusivamente para la pesca deportiva, sin embargo existen numerosas flotas artesanales que lo capturan de manera ilegal, por lo que existe el interés por abrir la pesca comercial de este recurso. Para establecer un plan de manejo que beneficie a ambos sectores pesqueros es necesario conocer si en el noroeste del Pacífico mexicano y Golfo de California el dorado se encuentra formando una sola población o si se encuentra estructurado en varias poblaciones. Con el objetivo de determinar si existe estructura poblacional, se analizaron individuos de 5 localidades en el 2005 (Cabo San Lucas, Loreto, Guaymas, Puerto Libertad y Topolobampo) y de 8 localidades en el 2006 (Cabo San Lucas, Loreto, Guaymas, Mazatlán, Nayarit, La Paz, Punta Lobos y una muestra Oceánica) con cinco loci microsatélites, los cuales se considera que tienen mayor resolución que otros tipos de marcadores moleculares. Se analizaron los niveles de variabilidad genética (Na, Ne, Ho, He, Fis) de cada localidad en ambos años. Para detectar estructura genética poblacional se calcularon los valores pareados de Fst y simultáneamente se utilizó un método bayesiano de asignación de individuos (STRUCTURE). El número de migrantes entre localidades y el tamaño efectivo poblacional de cada localidad se calculó a partir de las frecuencias alélicas así como por un método de máxima verosimilitud (MIGRATE). Para apoyar estas pruebas también se realizó un Análisis Factorial de Correspondencia, AMOVA y una prueba de aislamiento por distancia. Se encontraron niveles de variabilidad genética elevados, los valores de Fst demostraron que en el 2005 se presentó una ligera pero significativa diferenciación genética entre todas las localidades (Fst entre 0.009 y 0.027) mientras que en el 2006 solamente en tres comparaciones se encontró diferenciación genética (Fst entre -0.012 a 0.016). De las tres localidades que se colectaron en ambos años (Cabo San Lucas, Loreto y Guaymas) solamente Guaymas presentó diferencias genéticas en los años estudiados. Por otro lado, STRUCTURE no logró detectar diferencias genéticas en ambos años. El número de migrantes calculados presentó diferencias según el método empleado, aunque con ambos métodos se observó una cierta tendencia a un mayor flujo hacia la costa oriental del Golfo de California [...]
dc.descriptionDolphinfish Coryphaena hippurus is a highly migratory pelagic fish that in Mexico is reserve exclusively to recreational fisheries, although there are many artisanal float that capture this species illegally, so there is an interest in open this resource to commercial fisheries. To establish a management plan that benefit both sectors it is important to know if the dolphinfish in Northwest of the Mexican Pacific and Gulf of California is a single population or its structured in different populations. With the objective of evaluate the population structure, it was analyzed individual form 5 locations in 2005 (Cabo San Lucas, Loreto, Guaymas, Puerto Libertad and Topolobampo) and 8 locations in 2006 (Cabo San Lucas, Loreto, Guaymas, Mazatlán, Nayarit, La Paz, Punta Lobos and an oceanic sample) with five microsatellite loci wish have more resolution power compared to other kinds of molecular markers. It was analyzed the levels of genetic variability of every location for both year (Na, NE, Ho, He and Fis). Genetic population structure was evaluated with Fst values for each population pair and a bayesian method (STRUCTURE) were used simultaneously. The number of migrant between localities and the effective population size were calculated in base of allele frequencies and with a maximum likelihood method (MIGRATE). Also it was made a factorial correspondence analysis, an AMOVA and an isolation by distance test for support the results. It was found high levels of genetic variability in both years, Fst values showed that in 2005 there was a small but significant genetic differentiation between samples (Fst between 0.009 to 0.027), but in 2006 only three comparisons were significant (Fst between -0.012 to 0.016). Of the three localities that were sampled in both years (Cabo San Lucas, Loreto and Guaymas) only Guaymas showed significant genetic differentiation between years. On the other side, STRUCTURE didn’t find any genetic differentiation in both years. The calculated numbers of migrants were different according to the method that was used, however, in both methods there was a certain tendency to a more flux of migrant to the west coast of Gulf of California [...]
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherCentro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/AUTOR/Coryphaena hippurus; Estructura poblacional; Microsatélite
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/6
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/31
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/3105
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/310504
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/310504
dc.titleAnálisis de la estructura genética poblacional del dorado (Coryphaena hippurus; linnaeus, 1758) en el noroeste del pacífico mexicano y Golfo de California mediante el uso de microsatélites.
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersion


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