La dinámica poblacional de dinoflagelados meroplanctónicos fue estudiada en Bahía Concepción, B.C.S., de 1999 al 2001. Se realizó un seguimiento y análisis de la distribución de quistes de dinoflagelados en sedimentos Holocénicos, su abundancia y composición taxonómica; así como de la relación existente entre factores hidrológicos y la presencia de dinoflagelados meroplanctónicos y los periodos de producción de sus quistes. La composición de los quistes en los sedimentos, estuvo integrada por Peridiniales calcáreos, Peridiniales orgánicos y Gymnodiniales; identificándose a nivel de especie un total de 25 morfotipos. Los quistes vacíos constituyeron el 75-90% con la dominancia de los Peridiniales calcáreos (30-70%) y Gonyaulacales (13-44%), representados principalmente por Scrippsiella trochoidea y Lingulodinium polyedrum. También es de particular importancia el hallazgo del quiste del dinoflagelado tóxico Gymnodinium catenatum y los primeros registros para el Golfo de California de Alexandrium margalefii, Protoperidinium americanum, P. denticulatum y P. latissimum, lo que permite ampliar su rango de distribución hacia zonas sub-tropicales del Pacifico Mexicano, particularmente el área del Golfo de California. En el primer centímetro de sedimento, la abundancia varió entre 173 y 9, 933 quistes g-1 (peso húmedo) y se observó que ésta se incrementa hacia el interior de la bahía. El patrón de distribución y abundancia de los quistes sugiere que la bahía actúa como una trampa y que su composición refleja una comunidad que se desarrolla localmente. A través de ensayos de germinación fue posible establecer la relación quiste-teca de: Alexandrium margalefii y Protoperidinium denticulatum; así como el establecimiento de los cultivos de A. margalefii, Gonyaulax digitale, Gonyaulax spinifera, Gymnodinium catenatum, Lingulodinium polyedrum, Protoceratium sp., Protoperidinium denticulatum y Scrippsiella trochoidea. La producción in situ de quistes de dinoflagelados fue registrada por primera vez en México. El estadio de reposo del dinoflagelado tóxico G. catenatum y del potencialmente tóxico Alexandrium pseudogonyaulax, así como de otras especies formadoras de marea roja fueron encontrados en trampas. La composición de los quistes recién formados fue comparable a la del estadio móvil en la columna de agua. La tasa de incorporación de quistes fue comparable a la reportada en diferentes ambientes costeros del mundo [...]The population dynamics of meroplanktonic dinoflagellates, with a special emphasis on their resting cysts, was studied in Bahía Concepción, Baja California Sur, Mexico, in 1999-2001. Monitoring and analysis of dinoflagellate cyst distribution in Holocene sediments, their abundance and taxonomic composition, seasonality of dinoflagellates and cyst production periods related to hydrological factors were considered. Cyst composition in sediments included the calcareous and organic Peridiniales, Gonyaulacales, and Gymnodiniales, with 25 morphotypes identified at species level. Empty thecae constituted 75-90% of cyst assemblages dominated by the calcareous Peridiniales (30-70%) and Gonyaulacales (13-44%), represented mainly by Scrippsiella trochoidea and Lingulodinium polyedrum. Of particular note is the occurrence of cysts of the toxic dinoflagellate Gymnodinium catenatum, as well as the first records of Alexandrium margalefii, Protoperidinium americanum, P. denticulatum and P. latissimum in the Gulf of California. These occurrences extend their geographic distribution to the subtropical Mexican Pacific, mainly in the Gulf of California. In the uppermost centimeter of sediment, counts varied from 173 to 9,933 cysts g-1 of wet weight, and increased in abundance in the inner area of the bay. Cyst abundance and distribution patterns suggest that the bay acts as a cyst trap, and that cyst assemblages reflect the local community of meroplanktonic dinoflagellates. With cyst germination assays, it was possible to register Alexandrium margalefii and Protoperidinium denticulatum for the first time in the Gulf of California and to establish cultures of Alexandrium margalefii, Gonyaulax digitale, G. spinifera, Gymnodinium catenatum, Lingulodinium polyedrum, Protoceratium sp., Protoperidinium denticulatum, and Scrippsiella trochoidea. In situ production of dinoflagellate cysts was recorded for the first time in Mexico. The resting stages of toxic Gymnodinium catenatum and potentially toxic Alexandrium pseudogonyaulax, as well as other red tide-forming dinoflagellates, were collected in cyst traps. Cyst assemblages were linked with the composition of vegetative stages in the water column. Production yields were found to be comparable with those in other areas worldwide.