La jaiba café (Callinectes bellicosus) es una especie importante en el Golfo de California, particularmente para el litoral de Sonora, en donde la jaiba es el segundo recurso en valor económico para los pescadores artesanales. En el Golfo de California, la pesquería de jaiba inició a mediados de la década de 1980 y se desarrolló plenamente desde 1992; sin embargo, en los últimos 10 años se ha observado una tendencia decreciente en las capturas y la biomasa de esa especie. La pesquería de jaiba de Sonora se lleva a cabo en al menos 14 comunidades, desde Puerto Peñasco (Norte) hasta Bahía Agiabampo (Sur); estos dos extremos presentan las máximas capturas, seguidos de Bahía de Kino. La pesquería de jaiba cuenta con una Norma Oficial Mexicana que regula los artes de pesca y esfuerzo el litoral del Océano Pacífico. A partir de 2013 entró en vigor una veda que comprende dos etapas: veda total para organismos de ambos sexos del 1 mayo al 30 junio, y para hembras del 1 julio-31 agosto de cada año. Adicionalmente, la pesquería cuenta con un plan de manejo pesquero para Sinaloa y Sonora. En estos tres instrumentos se consideró implícitamente que la jaiba capturada en Sonora tiene una distribución homogénea. Pese a lo anterior, C. bellicosus parece tener una distribución heterogénea (en “parches”) probablemente debido a factores ambientales no idóneos para la especie. Con el fin de investigar si la jaiba café tiene un arreglo metapoblacional a lo largo de la costa de Sonora, el objetivo de esta tesis fue determinar la estructura y dinámica poblacional con base en el análisis de características morfológicas, genéticas, demográficas y de hábitat. Se desarrollaron modelos poblacionales por separado y un modelo metapoblacional que permitieran inferir estrategias de manejo. Para lo anterior, se construyeron modelos de biomasa dinámicos de Schaefer de cada una de siete poblaciones de jaiba para las que se estimaron las tasas de migración anual mediante análisis genéticos. Los modelos fueron parametrizados primero por separado y posteriormente se interconectaron con las tasas de migración. Los datos utilizados para la mayoría de los análisis se obtuvieron a partir de muestreos de las descargas comerciales y a bordo de embarcaciones artesanales en 14 comunidades pesqueras a lo largo de la costa de Sonora, abarcando los periodos de 1998-2002 y 2012-2015 [...]The brown swimming crab (Callinectes bellicosus) is a very important species in the Gulf of California, particularly along the coast of Sonora where it is the second most valuable fishery for artisanal fishers. This fishery started in the mid 1980’s and fully developed since 1992; however, a decreasing trend in catch and biomass has occurred over the past decade. In Sonora, the brown crab fishery is captured in at least 14 communities, from Puerto Peñasco in the North to Agiabampo Bay in the South; the highest catches are done in those two zones, followed by Kino Bay. This fishery is regulated by a Mexican Official Standard that norms fishing gear and effort in the Mexican Pacific. Since 2013, a two-phase ban for the states of Sinaloa and Sonora is also in place: for both sexes from May 1 to June 30, and for females from July 1 to August 31 each year. The fishery has also a management plan for Sinaloa and Sonora. Those three management instruments implicitly consider that the brown crab captured along the coast of Sonora is homogeneously distributed. Nevertheless, C. bellicosus appears to have a heterogeneous (“patchy”) distribution most likely due to environmental factors less than ideal for the species. To investigate a possible metapopulation array of the brown swimming crab along the coast of Sonora, the objective of this dissertation was to determine its structure and population dynamics, analyzing morphological, demographic and genetic characteristics, as well as its habitat. Individual population models and a metapopulation model were developed to gain insight on alternative management strategies for the brown crab along the coast of Sonora. To achieve this, Schaefer biomass-dynamic models were built for each one of seven brown crab populations for which migration rates were estimated based on genetic analyses. Models were first parameterized individually and then were interconnected including the estimated migration rates. Data for most of the analyses were obtained from samples of commercial landings and on board small scale fishing boats in 14 fishing communities along the coast of Sonora, during two periods: 1998-2002 and 2012-2015 [...]