En el Pacífico mexicano se distribuyen dos especies de langostas que forman parte de un recurso pesquero de alto valor económico. La langosta roja (Panulirus interruptus) es una especie de ambiente templado que se distribuye en California, a lo largo de la costa oeste de la Península de Baja California y en algunas localidades del Golfo de California. La langosta azul (P. inflatus) es una especie tropical que se distribuye desde el sur de la Península de Baja California hasta el estado de Oaxaca. Debido a su importancia económica casi todos los estudios se han enfocado a proporcionar datos biológicos-pesqueros. Sin embargo pocos esfuerzos han sido conducidos para estudiar la genética poblacional de estas especies. En el presente trabajo se estudió la estructura poblacional de la langosta roja y de la langosta azul con base en análisis genéticos. Se obtuvieron 229 muestras de tejido muscular de la langosta roja de seis sitios (Bahía Magdalena, San Juanico, Punta Abreojos, Punta Eugenia, Isla Guadalupe y Ensenada) ubicados del lado oeste de la Península de Baja California y se realizó un análisis de Polimorfismo de Longitud de Fragmentos de Restricción (RFLP, por sus siglas en inglés) basada en una región del ADN mitocondrial (ADNmt) conformada principalmente por la región control. La langosta azul fue estudiada a partir de secuencias provenientes de tres fragmentos del ADNmt: Región control (n=112), 12S (n=112) y 16S (n=113) obtenidos de muestras colectadas en Baja California Sur, Sinaloa, Nayarit, Jalisco y Guerrero. También se obtuvieron medidas del cefalotórax de 129 langostas azules provenientes de la costa oeste de Baja California Sur, Nayarit y Sinaloa con el fin de realizar una comparación morfométrica entre individuos de la península y del macizo continental. Los análisis genéticos fueron enfocados a determinar la variabilidad genética (número de haplotipos, diversidad haplotípica y diversidad nucleotídica), la heterogeneidad de las frecuencias de haplotipos (mediante Chi-cuadrada basada en simulación de Monte Carlo) y la estructuración poblacional a partir de la partición de la variancia dentro y entre las poblaciones (análisis molecular de varianza, AMOVA). La relación entre las poblaciones también fue revisada mediante análisis filogeográficos utilizando árboles del vecino mas cercano (Neighbor-Joining ) [...]Two economically spiny lobster species are distributed in the Mexican Pacific. The California spiny lobster (Panulirus interruptus) is a temperate species distributed in California, along the west coast of the Baja California Peninsula and in some localities of the Gulf of California. The blue spiny lobster (P. inflatus) is a tropical species distributed from southern Baja California Peninsula to Oaxaca. Due to their economic importance studies have been focused to provide biological-fishing data. However few efforts have been conducted to study the population genetics of these species. In this study, population structure of the California red lobster and the blue lobster were analyzed using genetic techniques. Two hundred twenty nine tissue samples of California lobster were obtained from six localities from the west coast of the Baja California Peninsula (Bahía Magdalena, San Juanico, Punta Abreojos, Punta Eugenia, Isla Guadalupe and Ensenada) and an analysis of RFLPs was carried out based in a region of the mtDNA (composed mainly by the control region). The blue spiny lobster was studied using sequence data of three mtDNA fragments: the control region (n = 112), 12S (n = 112), and 16S (n = 113) obtained of samples from the states of Baja California Sur, Sinaloa, Nayarit, Jalisco y Guerrero. Also, 129 cephalotorax measures were obtained from Baja California Sur, Nayarit and Sinaloa in order to carry out a morphometric comparison between lobster from the peninsula and the continent. In the two species, genetic analyses were focused to determine the genetic variability (number of haplotypes, haplotype diversity and nucleotide diversity), the heterogeneity of the haplotype frequencies (by means of X2 based on Monte Carlo simulation) and the population structure comparing the variance partition within and among populations (analysis of molecular variance, AMOVA). The relation among the populations was also reviewed from Neighbor-Joining trees. The morphometric analysis of blue spiny lobster was carried out using multivariate morphometry, particularly using an Sheared Principal Component Analysis (SPCA) to analyze the components related to the cephalotorax shape. Sixty five haplotypes and a relatively high and similar diversity among localities were observed in the California spiny lobster [...]