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Caracterización del gen de la miostatina como un regulador negativo del crecimiento muscular en la almeja mano de león Nodipecten subnodosus y análisis de la expresión génica en el músculo aductor en respuesta a estrés nutricional
| dc.contributor | ANA MARIA IBARRA HUMPHRIES | |
| dc.contributor | SILVIA ALEJANDRA GARCIA GASCA | |
| dc.creator | ROSA MARIA MORELOS CASTRO | |
| dc.date | 2015-07-14 | |
| dc.identifier | http://cibnor.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1001/97 | |
| dc.identifier.uri | http://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/2180 | |
| dc.description | La almeja mano de león, Nodipecten subnodosus, es el pectínido más grande de las costas del Pacífico en el continente Americano, con un músculo aductor de alto valor comercial. La miostatina es una proteína de la superfamilia de TGF-β cuya función en vertebrados es el control del crecimiento muscular. En este trabajo se aisló la secuencia completa del transcrito de la miostatina de Nodipecten subnodosus con fines de estudiar su participación en el crecimiento de esta especie. Se aisló un transcrito con un ORF de 1380 pb que codifica para una proteína de 459 aa con alta identidad a la previamente aislada en otros pectínidos, pero encontrando dos sitios de procesamiento proteolítico, el previamente reportado (RSKR) y un segundo en una posición 266-269 aa (RRKR), lo que es importante ya que la presencia de más de un sitio de procesamiento proteolítico en otras proteínas de la superfamilia de las TGF- β ha sido asociada con la posible generación de variantes y con mecanismos de señalización tisular de corto y largo alcance. Otro resultado no antes visto en pectínidos es que se identificaron dos UTR-5’s, los cuales presentan tamaños diferentes (234 y 57 pb); el análisis in silico mostró que la UTR-5’ más larga presenta una secuencia consenso tata-box (TATAAA) que explica el transcrito más corto ya que se localiza 27 pb antes del inicio del transcrito corto. La UTR-3’ contiene varios elementos cis-reguladores de la traducción, pero en particular se encontraron varias K-boxes, con una de ellas presente en todas las secuencias de mstn de pectínidos, infiriéndose que puede representar un sitio de reconocimiento de miRNAs. Finalmente, durante la caracterización del transcrito de la mstn se encontró un transcrito variante en diversos tejidos, el cual se infiere que es resultado de un splicing alternativo, el cual de ser traducido, daría lugar a una proteína trunca justo antes del sitio proteolítico que da lugar a la MSTN madura. A partir de la secuencia obtenida se realizaron varios estudios y experimentos en los que se evaluó por qPCR la expresión de la miostatina; debido a la presencia del splicing alterno, se evaluó la expresión de transcritos utilizando cebadores que amplifican solo transcritos sin el splicing (deleción) alterno así como ambos posibles transcritos (con y sin splicing) [...] | |
| dc.description | The Pacific lion-paw, Nodipecten subnodosus, is the largest pectinid species in the Pacific coast of the American continent, and its adductor muscle is highly priced. Myostatin is a member of the TGF-β protein superfamily which controls muscle growth. In this work, the full sequence of the myostatin transcript from N. subnodosus was isolated to study its role in muscle growth regulation in this species. The transcript contains a 1380 bp ORF encoding for a 459 aa protein, showing high identity to previously isolated transcripts from other pectinids, but, in this case, finding two proteolytic-processing sites, the previously reported (RSKR), and a second one at 266-269 aa (RRKR), which is important since more than one proteolytic-processing site in other members from the TGF-β superfamily have been associated with transcription of variants and tissue signaling mechanisms at short and long range. Another result reported for the first time in pectinids is the identification of two 5’ UTRs of different size (234 and 57 bp); in silico analysis showed that the longer 5’ UTR contains a consensus tata-box sequence (TATAAA) 27 bp upstream the first base of the shorter transcript. The 3’ UTR contains several cis-acting elements for translation, particularly several K-boxes, one of them is present in all myostatin sequences from pectinids, suggesting that it represents a miRNA recognition site. Finally, during the characterization of the mstn transcript, a variant was found in several tissues, probably derived from alternative splicing which, in case it is translated, would produce a truncated protein just before the proteolytic site which is important to produce the mature protein. The expression of myostatin was analyzed in several experiments by qPCR; due to the presence of potential alternative-spliced variants, these were evaluated using different sets of primers; one set amplifies only the unspliced variant, while the other amplifies both variants [...] | |
| dc.format | application/pdf | |
| dc.language | spa | |
| dc.publisher | Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
| dc.rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0 | |
| dc.subject | info:eu-repo/classification/Autor/Nodipecten subnodosus; Genética | |
| dc.title | Caracterización del gen de la miostatina como un regulador negativo del crecimiento muscular en la almeja mano de león Nodipecten subnodosus y análisis de la expresión génica en el músculo aductor en respuesta a estrés nutricional | |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
