Análisis de las comunidades microbianas de tapetes laminados de los ambientes hipersalinos de Laguna San Ignacio y Guerrero Negro Baja California Sur, México
Abstract
Se caracterizaron independientemente las comunidades de cianobacterias y bacterias de nueve tapetes microbianos laminados, de los ambientes hipersalinos intermareales e inundados permanentemente de Laguna San Ignacio y Guerrero Negro, Baja California Sur, México. A partir de la extracción de ADN total se obtuvo huellas genéticas de las comunidades microbiológicas, por electrofóresis en gel con gradiente desnaturalizante (DGGE) para el gen de 16S ARNr, usando la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) con primers específicos para cada grupo. Se estimó la riqueza (OTUs) y diversidad (indice de Shannon-Wiener), utilizando los perfiles electroforéticos obtenidos por DGGE. Se caracterizó parcialmente la macro-estructura de los tapetes laminados y se desarrolló el análisis de agrupación con la ayuda del coeficiente de similitud de “DICE” y el método UPGMA para comparar las comunidades de cianobacterias y bacterias de los primeros 20 mm de la laminación. No se registraron diferencias significativas (p > 0.05) en la riqueza para las comunidades de cianobacterias de Laguna San Ignacio y Guerrero Negro. Las comunidades bacterianas de Laguna San Ignacio registraron una mayor riqueza y diversidad que las comunidades de Guerrero Negro. La estructura de las comunidades microbiológicas presentaron una clara heterogeneidad, con un valor >3.4% de similitud (de acuerdo a UPGMA y el coeficiente de similitud DICE) para el grupo de las cianobacterias y >9.2% para las comunidades bacterianas. Los resultados obtenidos, sugieren la ausencia de relación entre la riqueza, diversidad y la estructura de la comunidad de cianobacterias respecto la macro-estructura de los tapetes laminados.