dc.contributor.advisor | López Cortés, Alejandro | es_MX |
dc.contributor.author | Aguilar Méndez, Mario Josué | es_MX |
dc.date.issued | 2008 | es_MX |
dc.identifier.uri | http://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/208 | |
dc.description.abstract | Se describe por vez primera la diversidad bacteriana del estómago de dos especies de eufáusidos subtropicales Nyctiphanes simplex y Nematoscelis difficilis y aquella asociada al tejido infectado de N. simplex por el ciliado del género Collinia spp. N. simplex es el eufáusido numéricamente dominante en el noroeste de México. En Bahía Magdalena y en el Golfo de California se encontraron bacterias en el hemocele de N. simplex infectados y en asociación a los ciliados en la etapa de vida libre. Un ensamble de componentes microbianos bacteria-ciliado, producto del proceso de parasitosdismo resultan en filamentos mucilaginosos con forma y tamaño similar a nieve marina. Se contaron y se aislaron cepas bacterianas del estómago de ambas especies y tejido infectado de N. simplex. También se extrajo ADN de estómagos sanos de ambas especies de krill e infectados de N. simplex. La identificación bacteriana fue realizada mediante la secuenciación del 16S ARNr tanto de cultivos como de las unidades taxonómicas operacionales (OTUs) recuperadas mediante geles de electroforesis en gradiente desnaturalizante (DGGE). Los antecedentes sobre la diversidad bacteriana en estómagos de krill se han inferido únicamente empleando métodos cultivo-dependientes, y sólo para especies de krill con distribuciones zoogeográficas en áreas templadas y polares. En este estudio se presenta el análisis de comunidades de bacterias asociadas a especies de krill saludables e infectados, previamente desconocidas, de una zona de transición climática-oceanográfica con influjo de masas de agua templada y tropical. Los estómagos de N. simplex y N. difficilis saludables presentaron entre ellos una carga bacteriana similar. Durante la infección temprana se observó una reducción de la densidad bacteriana cultivable, el incremento de las unidades formadoras de colonias en la infección tardía se relaciona con el abatimiento del sistema inmune del krill debido al proceso de parasitoidismo. El análisis de las comunidades bacterianas mediante DGGE mostró valores altos de dominancia para la etapa de infección tardía y durante el proceso de formación de filamentos, la mayor diversidad de OTUs no cultivables se relaciona a la etapa de fase libre del ciliado. La estrategia polifásica complementó el análisis de donde resultaron al menos 17 géneros de bacterias, cuatro pertenecieron a OTUs no cultivados y el 73% de las secuencias correspondieron al linaje de las γ-proteobacteria. A partir de la similitud encontrada entre las bacterias del estómago de krill sano e infectado así como entre el hemocele infectado y los filamentos proponemos que el mecanismo de infección del ciliado es de origen trófico. | es_MX |
dc.language.iso | es | es_MX |
dc.publisher | Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | es_MX |
dc.title | Diversidad bacteriana asociada al parasitoidismo de ciliados Collinia Spp. en eufáusidos del Golfo de California | es_MX |
dc.documento.id | cibnor.2008.aguilar_m | es_MX |
dc.documento.indice | aguilar_m | es_MX |
dc.documento.inst | cibnor | es_MX |
dc.dirtesis.grado | Maestría en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales | es_MX |
dc.dirtesis.disciplina | Biología Marina | es_MX |
dc.dirtesis.universidad | Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | es_MX |
dc.dirtesis.facultad | Posgrado en Recursos Naturales | es_MX |
dc.documento.fecha | Julio, 2008 | es_MX |
dc.description.abstracten | The bacterial diversity of the stomach of two subtropical euphausiid species, Nyctiphanes simplex and Nematoscelis difficilis and those associated with the infected tissue of N. simplex by the parasitoid ciliate of the genera Collinia, are described. N. simplex is the numerically dominant euphausiid throughout northeastern Mexico. Bacteria were discovered in the hemocoel of infected N. simplex and associated with the free-swimming ciliate stages from krill samples collected at Bahía Magdalena and the Gulf of California. The parasitoidism of N. simplex includes a bacteria-ciliate assemblage that form mucilaginous filaments similar in form and size to “marine snow”. Bacterial strains were counted and isolated. DNA was extracted from the stomach of healthy specimens of both krill species and from infected tissue of N. simplex. Bacteria were identified using the 16S RNAr sequences from bacterial strains and from the operational taxonomic units (OTUs) retrieved by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). Previous studies to estimate bacterial diversity in krill have been inferred using culture-dependent methods exclusively in temperate and polar krill species. We describe a novel bacterial community associated with healthy and infected temperate and tropical krill species. The stomach of healthy N. simplex and N. difficilis had similar counts of colony forming units. During the early infection phase, a reduction of bacterial load was observed and during the late infection the viable bacteria increased, probably associated with the compromised immune system of the krill caused by parasitoid ciliate histophagy. The DGGE community analysis showed high dominance during the late infection and filament-forming process. The highest diversity of uncultured OTUs was related to the free-swimming ciliate stage. A polyphasic methodological approach was used to complement the analysis, resulting in identification of at least 17 bacteria genera, four of them belonging to uncultured OTUs. About 73% of the sequences correspond to the γ-proteobacteria lineage. From the high similarity of the bacterial community of healthy and infected N. simplex and the similarity between the bacterial community in infected hemocoels and the filaments, we concluded that Collinia infection is a trophic mechanism. | es_MX |
dc.documento.subject | Collinia; asociación bacteria-ciliado; krill | es_MX |