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dc.contributor.advisorAlvarez Castañeda, Sergio Ticules_MX
dc.contributor.authorTrujano Alvarez, Ana Liliaes_MX
dc.date.issued2007es_MX
dc.identifier.urihttp://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/182
dc.description.abstractLos atributos fisiográficos y la historia geológica que tiene la península de Baja California han afectado la distribución de la flora y fauna presente a lo largo del tiempo. La Península posee un gran número de especies de vertebrados endémicos. Se estima que el grupo de mamíferos tiene aproximadamente un 24 % de formas endémicas al nivel de especie y 67 % a nivel subespecie. Entre los mamíferos presentes en la península, las tuzas de la especie Thomomys bottae (Eydoux y Gervais 1936) tienen la capacidad de adaptarse a una amplia gama de condiciones, como consecuencia, las poblaciones presentan un alto nivel de variación genética y morfológica (plasticidad fenotípica). Debido a esta última característica se ha identificado 27 subespecies para la península. Las tuzas por ser organismos fosoriales, presentan una elevada relación al sustrato, para la construcción de sus madrigueras, así mismo son organismos con una baja tasa de dispersión, y con base en la coalescencia se ha determinado su presencia en la peninsula es muy reciente. Lo cual hace a esta especie un modelo adecuado para estudiar la variación genética y morfológica, con el objetivo de dirigir el conocimiento hacia aspectos filogenéticos, biogeográficos y taxonómicos, que nos permitan conocer la biodiversidad en la península. El objetivo de este trabajo es integrar la información obtenida de los análisis de la variación morfológica y genética de las poblaciones de Thomomys bottae distribuidas en la península de Baja California para poder inferir las relaciones filogenéticas, distribución de sus linajes y la estructura poblacional de la especie, así como corroborar la validez taxonómica de las diferentes subespecies. Para lograr este objetivo el trabajo esta dividido en dos partes, la primera se relaciona con seis subespecies (T. b. anitae, T. b. alticolus, T. b. magdalene, T. b. russeolus, T. b. imitabilis, T. b. incomptus, y T. b. litoris), distribuidas en la parte sur de la península, principalmente en las tierras bajas, de las que se analizó la variación morfológica y genética de ejemplares colectados en 42 localidades ubicadas desde Guerrero Negro hasta la región del Cabo en el estado de Baja California Sur. La evaluación de la variación morfológica se realizó con caracteres craneales, y de coloración, para el análisis de la variación genética se utilizaron fragmentos de 500pb del gen mitocondrial Citocromo b. Con base en los resultados de los análisis de variación se demuestra lo siguiente 1) Existe una distribución continua de las subespecies presentes en las tierras bajas. 2) Se encontraron diferencias genéticas y morfológicas entre las poblaciones.3) Existe una elevada variabilidad a nivel intrapoblacional. 4) Se presentan dos grupos bien definidos, el primero corresponde a las poblaciones de cinco subespecies localizadas al sur de Guerreo Negro, y el segundo a las poblaciones de Guerrero Negro. 5) Se reconocen dos subespecies taxonómicas con base en la evaluación de caracteres morfológicos y genéticos reduciendo el número de unidades subespecificas a dos T. b. anitae y T. b. russeolus. La segunda parte de este estudio esta enfocado a analizar la estructura genética y filogeográfica que presentan las tuzas distribuidas en la península de Baja California. Con base en los estudios filogeográficos con otras especies de vertebrados se ha demostrado que los eventos geológicos ocurridos en la península son un factor determinante en la división de especies. Un claro ejemplo es la existencia de dos grupos monofiléticos asociados a dos diferentes áreas geográficas que dividen en norte y sur la distribución de algunas especies de vertebrados. Esta división tiene su origen en una interrupción del flujo genético en la parte media de la península. Se ha hipotetizado que este rompimiento del flujo genético esta altamente correlacionada con una barrera geográfica (evento vicariante) asociada a una transgresión marina que ocurrió hace 1.0 Ma. Con la finalidad de identificar si los eventos de vicarianza ocurridos en la península afectaron la distribución de los linajes de T. bottae. Se analizó la estructura genética y las relaciones filogenéticas de las poblaciones de esta especie en la península de Baja California. Se emplearon 174 ejemplares de 27 localidades incluyendo el sur de Estados Unidos. Los análisis se llevaron acabo a partir de 500pb del gen mitocondrial Citocromo b. Se empleo un análisis de varianza molecular y se realizaron inferencias filogenéticas. Con total de 127 haplotipos se construyeron redes de haplotipos. Los resultados filogenéticos demuestran la existencia de cuatro grupos asociados al mismo número de zonas geográficas. El primero se localiza incluye a las poblaciones del sur de los Estados Unidos. El segundo incluye desde el límite sur de Estados Unidos (frontera con México) y norte de la península. El tercero la parte media principalmente a las poblaciones distribuidas en la región conocida como el desierto de Vizcaino, y el último que incluye a la región desde el sur de la Laguna de San Ignacio hasta la región del Cabo. Se demuestra que existe una compleja estructura poblacional producto de una dinámica de contracción y expansión en las poblaciones. Se observan interrupciones del flujo genético coinciden con las reportadas para otros vertebrados en la parte media de la península, y se encuentran asociados a grupos monofiléticos. Sin embargo, y debido a que la coalescencia de T. bottae (471, 307 años) es más reciente que los eventos de vicarianza. Los factores que pueden estar afectando la estructura genética y filogeográfica de T. bottae pueden ser producto de: 1) La interrupción del flujo genético relacionada con factores asociados a los cambios climáticos ocurridos en el Pleistoceno. 2) El aislamiento por distancia, y 3) La existencia de un hábitat no optimo para la especie en la parte media de la península que limita la capacidad de dispersión de la especie a esta zona. De acuerdo con los datos obtenidos en este estudio y basados en los estudios de variación morfométrica y genética de la especie en el sur de la península se reconocen cuatro unidades subespecificas en toda la península, T. b. altivallis, T. b. nigricans, T. b. russeolus, y T. b. anitae.es_MX
dc.language.isoeses_MX
dc.publisherCentro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.es_MX
dc.titleEstudio de Thomomys bottae (Eydoux y Gervais) en Baja California : filogeografía e implicaciones taxonómicases_MX
dc.documento.idcibnor.2007.trujano_aes_MX
dc.documento.indicetrujano_aes_MX
dc.documento.instcibnores_MX
dc.dirtesis.gradoDoctorado en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturaleses_MX
dc.dirtesis.disciplinaEcologíaes_MX
dc.dirtesis.universidadCentro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.es_MX
dc.dirtesis.facultadPosgrado en Recursos Naturaleses_MX
dc.documento.fechaMarzo, 2007es_MX
dc.description.abstractenThe physiographic attributes and geologic history of the peninsula of Baja California have affected the distribution of its flora and fauna throughout time. The Peninsula has a high number of endemic species of vertebrates. Among the mammals 24 % of species and approximately 67 % of subspecies are endemic. Pocket gophers, Thomomys bottae (Eydoux and Gervais 1936), have the capacity to adapt to a wide range of conditions, and their populations contain a high level of genetic and morphological variation (phenotypic plasticity). There are 27 recognized subspecies for the peninsula. “Tuzas” (pocket gophers) construct underground burrows and therefore have a strong relationship with their substrate, also have low dispersal rates, and estimates of the coalescence times of Baja Thomomys populations are very recent. This species is a suitable model to study genetic and morphological variation, and analyzing aspects of its phylogenetics, biogeography and taxonomy, allows us to better understand the biodiversity in the peninsula. The principal aim is to perform an integrative analysis of morphological and genetic variation of Thomomys bottae populations from the peninsula of Baja California. In this study I infer the phylogenetic relationships, lineages distributions, and population genetic structure of T. bottae, and test the taxonomic validity of the different subspecies. In order to achieve this objective. I separated my work in two primary parts. The first part deals with analyzing the morphological and genetic variation of six subspecies (T. b. anitae, T. b. alticolus, T. b. magdalene, T. b. russeolus, T. b. imitabilis, T. b. incomptus, and T. b. litoris), that are primarily lowland forms distributed in the southern portion of the peninsula. I collected tuzas from 42 localities located from Guerrero Negro to the Cape Region in the state of Baja California Sur. I analyzed morphological variation using cranial characters and coloration, and analyzed genetic variation using a 500 bp portion of the mitochondrial gene cytochrome b. The results of these analyses showed: 1) A continuous distribution of the Thomomys subspecies in lowlands. 2) intrapopulation genetic an morphological differences. 3) Two genetic groups, the first includes the populations of five of the subspecies located to the south of Guerrero Negro, and the second are the populations of Guerrero Negro. 4) Two taxonomic subspecies are recognized based on the evaluation of morphological characters and genetic analysis, T. b. anitae and T. b. russeolus. The second part focused on the phylogeographic structure of pocket gophers on the peninsula of Baja California. Several studies of other species of vertebrates have demonstrated that geologic events in the peninsula are responsible for separating species. An example is in the middle part of the peninsula where historical disruption of gene flow has created species breaks resulting in monophyletic groups north and south of this origin. It has been hypothesized that breaks in gene flow are highly correlated with geographic barriers (vicariant events), such as the marine transgression that happened 1.0 Ma. My intention is to identify the historical vicariant events in the peninsula that affected the distribution of lineages of T. bottae. I analyzed the genetic structure and the phylogenetic relationships of Thomomys populations from across the peninsula of Baja California. I sequenced 500 bp of the mitochondrial gene cytochrome b of 174 samples from 27 localities including populations in the southern United States. The sequences were analyzed using analysis of molecular variance and phylogenetic inference. The phylogenetic results showed four associated groups, the same as the number of geographic zones. The first includes populations from the southern United States. The second includes the southern limit of the United States (border with Mexico) and the northern portion of the peninsula. The third occurs in the middle part of the peninsula including populations in the well-known desert of Vizcaino region. The last genetic group includes populations from south of the Laguna de San Ignacio to the Cape Region. Interruptions in gene flow observed here agree with the ones reported for other vertebrates in the middle part of the peninsula, and do form monophyletic groups. However, the coalescence time of T. bottae is much more recent (471 to 307 thousand years) than the vicariant event that disrupted other species. The factors that may affect the genetic and phylogeographic structure of T. bottae may be a product of: 1) The interruption of the gene flow related to recent climatic changes in the Pleistocene. 2) Isolation by distance, and 3) The existence of a non-optimal habitat for the species in the middle part of the peninsula that limits the capacity of dispersion of the species in this zone. In agreement with the data collected in this study and based on the studies of morphometric and genetic variation of populations in the southern portion of the peninsula four units are recognized on the Baja California peninsula, T. b. altivallis, T. b. nigricans, T. b. russeolus, and T. b. anitaees_MX
dc.documento.subjectThomomys bottae; Baja California; variación morfológica; filogeográfia; coalescenciaes_MX


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