"In a study of cross protection between plant viruses, two severe cucumber mosaic virus (CMV) isolates from field grown pepper plants, CMV-SD2 (subgroup I) and CMV-35 (subgroup II), did not elicit disease symptoms when inoculated to pepper plants previously infected with a mild CMV strain, CMV-S (subgroup II). To investigate the mechanism of this protection, replication of the RNA of each specific strain was assessed in various tissues of cross-protected and singly-infected pepper plants. DsRNA analysis was used for specific detection of the RNA of CMV-SD2 and CMV-S strains, which belong to different CMV subgroups. In plants cross-protected with CMV-S and challenged with CMVSD2, DsRNA analysis showed no detectable replication of CMVSD2 RNA in either challenge inoculated or systemically infected leaves. Because CMV-S and CMV-35 belong to the same CMV subgroup and have identical dsRNA patterns, an RNase protection assay based on the coat protein gene of RNA 3 was used to detect and distinguish the RNA of each strain. RNase protection analysis showed the absence of any detectable RNA of the challenge strain, CMV-35, in not inoculated and systemically- infected leaf tissue of protected and challenged plants. These results indicate that cross protection in pepper plants involved a lack of any detectable replication of the CMV challenge strain. This is the first report of a cross protection study involving CMV strains in which the protective strain prevented replication of challenge strains from both subgroups I and II.""En experimentos de protección cruzada con virus vegetales, dos aislamientos severos del virus mosaico del pepino (CMV) obtenidos en cultivos de chile, CMV-SD2 (subgrupo I) y CMV-35 (subgrupo II), no produjeron síntomas al ser inoculados en plantas de chile infectadas previamente con la variante benigna CMV-S (subgrupo II). Para investigar el mecanismo de protección observado, se analizó la replicación del ARN de cada variante viral en varios tejidos de las plantas protegidas con la variante benigna y de las plantas control. Análisis de dsARN se llevó a cabo para detectar específicamente el ARN de las variantes CMV-SD2 y CMV-S, las cuales pertenecen a diferentes subgrupos. En las plantas protegidas con CMV-S e inoculadas posteriormente con CMV-SD2, el análisis de dsARN no detectó replicación del ARN de CMV-SD2 en las hojas inoculadas o en hojas superiores. Debido a que CMV-S y CMV-35 pertenecen al mismo subgrupo y tienen patrones de bandas electroforéticas de dsARN idénticas, se usaron ensayos de protección con ARNasas basados en el gen de la cubierta viral proteínica del ARN 3, para detectar y distinguir el ARN de cada variante. El análisis de protección con ARNasas no detectó ARN de la variante agresiva, CMV-35, en tejido de hojas inoculadas y hojas superiores de plantas protegidas con CMV-S e inoculadas con CMV-35. Estos resultados indican que la protección cruzada en plantas de chile involucra la ausencia de replicación detectable de la variante retadora (challenge). Este es el primer reporte de un estudio de protección cruzada que involucra variantes de CMV, en el cual la variante protectora previno la replicación de las variantes retadoras de los subgrupos I y II."