dc.contributor.advisor | Vázquez Juárez, Ricardo | es_MX |
dc.contributor.advisor | Flores Ramírez, Sergio | es_MX |
dc.contributor.author | Munguía Vega, Adrián | es_MX |
dc.date.issued | 2002 | es_MX |
dc.identifier.uri | http://dspace.cibnor.mx:8080/handle/123456789/17 | |
dc.description.abstract | La Vaquita, Phocoena sinus, es una marsopa endémica del Alto Golfo de California, México. Es uno de los cetáceos más pequeños y de distribución más restringida, y actualmente se le reconoce como una especie críticamente amenazada. Su única población se estima en menos de 600 individuos, y ha estado sujeta a una mortalidad incidental por enmallamiento en redes de pesca al menos desde 1940. Lo anterior motivó el interés de investigar el riesgo de depresión por endogamia y el potencial adaptativo presente en la especie, y sus implicaciones en la extinción.
Las moléculas del Complejo principal de histocompatibilidad (Mhc) son cruciales para generar la respuesta inmune en vertebrados al capturar péptidos extraños y presentarlos en la superficie celular a los linfocitos T. La selección natural ha favorecido el gran polimorfismo de estos genes, lo que ha fomentado gran interés en su estructura, función, y su aplicación como marcadores moleculares para estudiar la historia y viabilidad de poblaciones silvestres y en cautiverio.
Se clonaron y secuenciaron fragmentos de ADN correspondientes a la Región de Unión del Péptido (exon 2) de genes del Mhc en una muestra de 3 individuos. Se encontraron 7 secuencias únicas muy poco divergentes entre sí y provenientes de al menos 3 loci Mhc clase-I, así como una sola secuencia en el locus DQB del Mhc clase-II. Las secuencias fueron depositadas en el GenBank, y su caracterización y comparación con secuencias similares de otras especies demostró que se trata de genes que codifican moléculas histocompatibles funcionales que muestran evidencias de la influencia de la selección natural en posiciones específicas de aminoácidos que son importantes en la unión de péptidos.
Asimismo se determinó el polimorfismo conformacional de cadena sencilla (SSCP) del locus DQB en 25 individuos, los que fueron homocigotos para el único alelo (Phsi-DQB*01) aislado anteriormente. Con tal información se simularon distintos escenarios demográficos recientes e históricos empleando modelos analíticos y computacionales que permitieran explicar la fijación de dicho alelo en la población, bajo un régimen de deriva genética. Los resultados indicaron un tamaño efectivo histórico en la vaquita de probablemente Ne ~500 durante al menos unos 10,000 años, y que corresponde a unas dos o tres veces su valor actual (Ne ~250). Su polimorfismo genético habría sido prácticamente nulo antes de su mortalidad incidental. Tal población históricamente pequeña podría haber purgado los alelos deletéreos de mayor efecto, lo que podría evitar que la especie sufriera de depresión por endogamia a diferencia de especies naturalmente abundantes y diezmadas recientemente. No obstante, debido a que paralelamente a la deriva genética la selección natural se torna ineficaz en poblaciones pequeñas, algunos alelos ligeramente deletéreos se habrían acumulado a lo largo del tiempo, lo que explicaría la presencia de polidactilia y malformaciones vertebrales en la especie. El monomorfismo de la región control mitocondrial, y del locus DQB indican la uniformidad genética de la vaquita, sugiriendo una gran vulnerabilidad y muy limitada capacidad para adaptarse a ambientes cambiantes. La información genética y evolutiva ahora disponible no sugiere que la vaquita sea una especie condenada a la extinción, por lo que un plan destinado a su recuperación y conservación está plenamente justificado. Así, la vaquita constituye una especie rara con una historia evolutiva y demográfica extraordinarias, merecedora de convertirse en un modelo de estudio único. | es_MX |
dc.language.iso | es | es_MX |
dc.publisher | Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | es_MX |
dc.title | Estudio del complejo principal de histocompatibilidad en la historia evolutiva y demográfica de la vaquita Phocoena sinus | es_MX |
dc.documento.id | cibnor.2002.murguia_a | es_MX |
dc.documento.indice | murguia_a | es_MX |
dc.documento.inst | cibnor | es_MX |
dc.dirtesis.grado | Maestría en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales | es_MX |
dc.dirtesis.disciplina | Biología Marina | es_MX |
dc.dirtesis.universidad | Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C. | es_MX |
dc.dirtesis.facultad | Posgrado en Recursos Naturales | es_MX |
dc.documento.fecha | Diciembre, 2002 | es_MX |
dc.description.abstracten | The Vaquita, Phocoena sinus, is an endemic porpoise of the Upper Gulf of California, Mexico. It is one of the smallest cetaceans, one of the most restricted in distribution and presently recognized as a critically endangered species. The unique population is estimated to be less than 600 individuals, and has been subject of an incidental mortality by entanglement in fishnets at least since the 1940’. This raised the concern to investigate the risk of inbreeding depression and the adaptive potential present in the species, and its implications for extintion.
Molecules of the Major histocompability complex (Mhc) play a key role in the immune response of vertebrates by recognizing foreign peptides and presenting them on the celular surface to T lymphocites. Natural selection has promoted a high polymorphism of this genes, raising increasing interest in its structure, function, and aplication as molecular markers to study the history and viability of wild and captive populations.
DNA fragments corresponding to the Pepetide Binding Region (PBR) of the second exon of Mhc genes were cloned and sequenced from 3 individuals. Seven unique sequences with a low degree of divergence and coming from at least 3 Mhc class I loci were found. A unique sequence was present at the locus DQB from Mhc class II. The sequences were registered in GenBank and a characterization and comparisson with analogous sequences from other species demonstrated they code for functional Mhc molecules that show evidences of the influence of the natural selection at specific positions of aminoacids functionaly involved on peptide binding.
Moreover, we studied the single stranded conformation polymorphism (SSCP) of the DQB locus in 25 individuals, all being homozygous for the single allele (Phsi-DQB*01) previously isoleted. Based on this information, different analitic and computer demographic scenerios were simulated to explain the fixation of such an allele under genetic drift. Results indicated a likely historic efective population size of Ne ~500 for at least some 10,000 years, that is only about two or three times the actual value (Ne ~250). The polymorphism had already been nearly zero before incidental mortality. Such an historically small population might have alredy purged those deleterious alleles of higher effect, which might prevent the species to suffer from inbreeding depression in contrast to a naturally abundant species that were reduced recently. Nevertheless, because in parallel with genetic drift natural selection becomes less efficient in small populations, some slightly deleterious alleles might have accumulated over time, which could explain the presence of polydactyly and vertebral malformations in the species. The monomorphism of the mitochondrial control region and the DQB locus indicate the genetic uniformity of the species, suggesting a high vulnerability and a very limited capacity to adapt to changing environments. The genetic and evolutionary information currently available do not suggest that the vaquita is a species doomed to extinction and therefore an appropiate recovery plan for its recovery and conservation is well justified. Thus, the vaquita consitutes a rather rare species with an extraordinary evolutive and demographic history, worthy of becoming an excellent and unique model of study. | es_MX |
dc.documento.subject | Vaquita; Phocoena sinus; Complejo principal de histocompatibilidad; Mhc | es_MX |