Estructura genética mediante SNPs en bancos de almeja generosa (Panopea globosa; Dall 1898) del Alto Golfo de California

Abstract

La almeja generosa (Panopea globosa) es un bivalvo sésil de amplia distribución en el Golfo de California y costa occidental de la península de B.C.S., la cual sostiene una pesquería creciente de gran importancia. Debido a ello, ha sido el objeto de estudio de múltiples trabajos de investigación, entre los que destaca la variabilidad genética con marcadores neutros sencillos (p.ej. microsatélites). Sin embargo, no se ha realizado un estudio a escala microgeográfica que permita identificar eventos en las poblaciones con marcadores genéticos capaces de diferenciar entre bancos, y mejorar el manejo de este recurso a nivel local. Esto se puede lograr con marcadores moleculares que tengan una elevada frecuencia en el genoma pues son los que tienen mayor potencial para evaluar la variabilidad genética. En el presente trabajo se realizó un acercamiento a la estructura genética dentro de las poblaciones del Alto Golfo de California (San Felipe, B.C., y Puerto Peñasco, Sonora), evaluando las frecuencias alélicas en bancos de P. globosa, mediante el uso de polimorfismos de una sola base (SNP), provenientes de la técnica de secuenciación de ADN asociada a dos sitios de restricción (ddRAD-seq). En total se obtuvieron 14,491 SNPs distribuidos en 8,326 loci, en los que se encontró una menor diferenciación entre bancos de la misma localidad (San Felipe). También se realizó una simulación de transporte de partículas con el modelo HAMSOM para evaluar la conectividad entre las dos poblaciones. Además, se detectaron 199 SNPs outlier con potencial para futuros análisis de asignación de origen (bancos). Con este trabajo se puso en evidencia que los bancos de almeja generosa en las localidades del Alto Golfo de California presentaron diferencias en las frecuencias alélicas en SNPs característicos entre los bancos de una misma localidad, y se observó una conectividad asimétrica entre las localidades, con una mayor retención de larvas en la localidad de San Felipe, y en menor grado un flujo de ésta hacia Puerto Peñasco.