Tesis de Doctorado

HERRAMIENTAS GENÓMICAS DE VANGUARDIA PARA EL MANEJO Y CONSERVACIÓN DE LA TOTOABA (Totoaba macdonaldi)

2026-01-01T00:00:00Z

HERRAMIENTAS GENÓMICAS DE VANGUARDIA PARA EL MANEJO Y CONSERVACIÓN DE LA TOTOABA (Totoaba macdonaldi) MORA MARTINEZ, JUAN PAULO "La Totoaba macdonaldi es un pez endémico del Golfo de California en peligro de extinción, sujeto a una intensa pesca ilegal por su buche y a un programa de repoblamiento mediante Unidades de Manejo para la Conservación de la Vida Silvestre (UMAs). Esta investigación tuvo como propósito caracterizar la diversidad, la estructura genética y el parentesco de la población silvestre y de los reproductores en cautiverio de dos UMAs: el Centro Reproductor de Especies Marinas del Estado de Sonora (CREMES) y la Universidad Autónoma de Baja California (UABC) a lo largo de tres generaciones, así como diseñar un panel reducido de SNPs in silico para la reconstrucción de pedigrí y la trazabilidad de la especie. A partir de la secuenciación ddRAD-seq de 145 individuos se obtuvo un conjunto neutral de 4,992 SNPs mediante ensamblaje de novo, con una profundidad de cobertura de 90× y un error de genotipificación de 0.03%. La población silvestre presentó una diversidad genética relativamente alta, ausencia de estructura genética (panmixia) y un tamaño efectivo poblacional grande (Ne > 9,000), mientras que los reproductores de las UMAs mostraron menor diversidad, una disminución progresiva de la riqueza alélica y la heterocigosidad esperada a lo largo de las generaciones, tamaños efectivos muy bajos (Ne < 20) y un elevado nivel de parentesco al interior de las UMAs. Se detectó diferenciación genética significativa entre la población silvestre y las UMAs, así como entre ambas UMAs. La asignación de origen con la base genómica completa tuvo una alta precisión de asignación, especialmente para los individuos silvestres con el set completo de SNPs. La selección de un panel reducido de 100 SNPs cuenta con elevada probabilidad de inclusión (> 97%) y de exclusión (> 97%) posibilitando la reconstrucción de pedigrí de ambas UMAs con la misma resolución que la base completa, y el panel combinado de 150 SNPs igualó el desempeño de asignación del conjunto de referencia. Se concluye que la totoaba silvestre presenta altos valores de variabilidad genética, en tanto que las UMAS requieren la incorporación de nuevos reproductores silvestres y el intercambio de material genético entre UMAs para frenar su erosión genética. El panel reducido de doble propósito constituye una herramienta potencialmente costo-efectiva y estandarizable para el manejo genético de las UMAs y la trazabilidad del recurso."

MODELO DE REDES NEURONALES ARTIFICIALES DE LA PRESENCIA DE DELFINES MEDIANTE MONITOREO ACÚSTICO PASIVO EN EL CANAL DE CERRALVO, B.C.S., MÉXICO

2026-01-01T00:00:00Z

MODELO DE REDES NEURONALES ARTIFICIALES DE LA PRESENCIA DE DELFINES MEDIANTE MONITOREO ACÚSTICO PASIVO EN EL CANAL DE CERRALVO, B.C.S., MÉXICO CRUZ VILLAGRAN, HAIDÉ "Comprender los factores que determinan la presencia y distribución de los cetáceos es fundamental para el estudio de su ecología, especialmente en ambientes marinos donde la observación directa resulta limitada. En este estudio se empleó el monitoreo acústico pasivo (PAM) en combinación con redes neuronales artificiales para modelar la presencia de delfines (familia Delphinidae) en el Canal de Cerralvo, Golfo de California, México. Se analizaron diez variables, incluyendo descriptores ambientales tanto físicos como bióticos, y proponiendo una variable denominada coocurrencia acústica interespecífica de cetáceos (CAIC). Definida como la detección acústica simultánea de diferentes especies, independientemente de su proximidad espacial o interacción directa. Los datos se obtuvieron entre noviembre de 2022 y diciembre de 2023 mediante 452 horas de grabaciones acústicas. El modelo con mejor desempeño alcanzó una exactitud del 81.7% y se identificó la CAIC, la velocidad del viento, la concentración de clorofila a, la relación entre la distancia del equipo de grabación y la costa, y el periodo del día como las variables con mayor influencia sobre la presencia de delfines. El análisis de importancia de variables mostró que la CAIC ejerció la mayor contribución positiva al modelo, siendo la ballena azul (Balaenoptera musculus) y el cachalote (Physeter macrocephalus), las especies detectadas con mayor frecuencia y de manera simultánea con delfines. Estos resultados demuestran el potencial de PAM y de las redes neuronales para modelar las relaciones ecológicas complejas, además de destacar la relevancia de la CAIC como un factor asociado al uso compartido del hábitat por los delfines."

RESPUESTA INMUNE Y NUTRICIONAL EN JUVENILES DE Seriola rivoliana CON DIETAS SUPLEMENTADAS CON HISTIDINA, BAJO CONDICIONES DE CULTIVO

2026-01-01T00:00:00Z

RESPUESTA INMUNE Y NUTRICIONAL EN JUVENILES DE Seriola rivoliana CON DIETAS SUPLEMENTADAS CON HISTIDINA, BAJO CONDICIONES DE CULTIVO Macías Reyes, Lizbeth Yanessa "La especie Seriola rivoliana comprende peces marinos carnívoros de alto valor comercial, reconocidos por su rápido crecimiento, elevada eficiencia alimenticia y excelente calidad de filete, características que han impulsado su interés en la acuacultura. Sin embargo, el desarrollo de su cultivo ha enfrentado retos técnicos relacionados con el conocimiento de sus requerimientos nutricionales específicos, debido a los altos requerimientos energéticos asociados a su naturaleza pelágica e intensa actividad natatoria. En las primeras etapas, la especie presenta un crecimiento acelerado y, durante la fase juvenil, es alimentada por primera vez con dietas formuladas. En esta etapa, deficiencias nutricionales pueden provocar menor crecimiento, baja eficiencia alimenticia y mayor susceptibilidad al estrés. En este sentido, los aminoácidos esenciales actúan como aditivos funcionales capaces de modular la salud del organismo. Entre ellos, la histidina ha mostrado efectos positivos sobre el crecimiento, la eficiencia alimenticia y el estado fisiológico en peces marinos, especialmente en dietas con bajo contenido de harina de pescado. Por ello, el presente estudio evaluó el efecto de la suplementación dietética con histidina en juveniles de Seriola rivoliana, analizando su impacto en el crecimiento y la respuesta inmune. Los resultados mostraron que la inclusión de histidina no produjo cambios significativos en el peso final, la tasa de crecimiento específica (TCE), el factor de conversión alimenticia (FCA) ni el índice de condición (K), coincidiendo con estudios previos en especies del mismo género. Sin embargo, se observó un incremento en la longitud corporal en los organismos alimentados con el mayor nivel de histidina, además de una menor expresión de los genes actina y miosina en músculo, lo que indica que la histidina favorece el crecimiento longitudinal más que el muscular. Asimismo, el tratamiento con mayor inclusión (S2) presentó mayor supervivencia y biomasa final. A nivel intestinal, la mayor longitud de vellosidades se registró en el tratamiento intermedio, mientras que el tratamiento con mayor inclusión promovió un incremento significativo en la producción de mucina. Esto sugiere que la histidina fortalece la barrera intestinal y reduce procesos inflamatorios y estrés oxidativo, evaluados mediante interleucinas y actividad de la enzima superóxido dismutasa..."

CONTRIBUCIÓN AL ESTABLECIMIENTO DE LA TECNOLOGÍA DE CULTIVO LARVARIO DEL CALLO DE HACHA Atrina maura MEDIANTE LA ADECUACIÓN DE LA DIETA, FOTOPERIODO Y USO DE MICROORGANISMOS PROBIÓTICOS

2026-01-01T00:00:00Z

CONTRIBUCIÓN AL ESTABLECIMIENTO DE LA TECNOLOGÍA DE CULTIVO LARVARIO DEL CALLO DE HACHA Atrina maura MEDIANTE LA ADECUACIÓN DE LA DIETA, FOTOPERIODO Y USO DE MICROORGANISMOS PROBIÓTICOS Cruz Cosío, Raúl "La acuicultura de Atrina maura es una actividad de creciente interés en el noroeste de México; sin embargo, la producción de semilla en laboratorio se ve limitada por las mortalidades masivas durante el cultivo larvario, los efectos del cambio climático y la aplicación de protocolos acuícolas extrapolados de otras especies. El presente estudio tiene como objetivo contribuir al establecimiento de la tecnología de cultivo larvario de Atrina maura mediante la adecuación secuencial de la dieta, fotoperiodo y el uso de microorganismos probióticos. El estudio se desarrolló en varias fases experimentales utilizando reproductores colectados en la Ensenada de La Paz (ELP) y Bahía Magdalena (BM). El desove se indujo mediante shocks térmicos, alternando la temperatura del agua entre 15 y 25°C. Se realizaron análisis macroscópicos e histopatológicos para evaluar el estado gonadal y la condición sanitaria de los reproductores. Durante el cultivo larvario inicial se evaluaron tres dosis de Isochrysis galbana (5,000, 10,000 y 20,000 cel·mL⁻¹). Posteriormente, se comparó el rendimiento larvario con dietas de I. galbana y Pavlova lutheri, así como la ingesta de microalgas de distinto tamaño celular (I. galbana, P. lutheri, Chaetoceros calcitrans y C. muelleri), tanto íntegras como fragmentadas. Finalmente, se aisló y evaluó in vivo la cepa bacteriana C29 como potencial probiótico sobre el rendimiento larvario. Los análisis revelaron una melanización de los tejidos en los reproductores a nivel macroscópico (ELP: 36.7 %; BM: 100%) e histológico (ELP: 62.7 %; BM:33.3 %) como respuesta inmune ante infecciones parasitarias por helmintos, organismos tipo Rickettsia y Perkinsus, afectando el acondicionamiento, la inducción a desove en un 80 % y dando lugar a gametos atrésicos. La dosis alimenticia óptima alcanzó un nivel de saturación ≥10,000 y <20,000 cel·mL⁻¹, siendo la dosis media la que promovió el mayor crecimiento larvario. La microalga P. lutheri indujo un crecimiento significativamente superior en comparación con I. galbana, destacando la importancia del tamaño celular y de una adecuación nutricional específica. La ingestión de microalgas se relacionó directamente con la talla larvaria, favorecida por partículas de menor tamaño. El fotoperiodo influyó significativamente en el crecimiento, con la luz continua (24:0) como la condición que promovió mayores tallas en altura y longitud, sin influir significativamente en la supervivencia..."

Variación en la distribución y biomasa de los peces componentes de la Fauna de Acompañamiento del Camarón en el Golfo de California

2026-01-01T00:00:00Z

Variación en la distribución y biomasa de los peces componentes de la Fauna de Acompañamiento del Camarón en el Golfo de California Pérez Burgos, Jesús Leobardo "El Golfo de California (GC) es un ecosistema marino de alta productividad y diversidad que alberga una de las pesquerías más importantes de México: la pesca industrial de camarón. Esta actividad genera una captura incidental significativa, conocida como Fauna de Acompañamiento del Camarón (FAC), compuesta principalmente de peces, muchos de los cuales carecen de información biológica y demográfica básica. El objetivo de esta tesis fue determinar la variación en la distribución y biomasa de cinco especies de peces de la FAC con interés comercial potencial (Balistes polylepis, Paralabrax maculatofasciatus, Sphoeroides annulatus, Haemulopsis elongatus y Diapterus brevirostris) en el GC, así como su relación con la variabilidad ambiental y escenarios de cambio climático. Se analizaron 947 lances de cruceros prospectivos realizados en julio y agosto del período 2002-2018. Se estimaron la estructura poblacional, la distribución latitudinal y batimétrica, así como la abundancia y la biomasa mediante el método de área barrida. Se evaluó la relación de la biomasa con variables ambientales (temperatura superficial del mar, clorofila a, índice MEI) mediante PERMANOVA y Modelos Aditivos Generalizados (GAMs), así como la distribución potencial mediante Modelos de Nicho Ecológico (MNE) con MaxEnt, y se proyectó la distribución potencial bajo los escenarios SSP2-4.5 y SSP5-8.5 (2050, 2090). Los resultados mostraron que las cinco especies se distribuyen a lo largo de toda el área de estudio, pero con concentraciones en las zonas sur y sureste. Se documentaron expansiones hacia el norte de H. elongatus durante La Niña 2011 y de D. brevirostris durante El Niño 2016, ampliando sus rangos reportados. La profundidad media de captura fue de 21-24 m (rango 5-69 m). La biomasa total estimada fue de 4,384.5 toneladas, con picos en 2011 (La Niña) y 2016 (El Niño). Los GAMs revelaron que la biomasa de H. elongatus y P. maculatofasciatus respondió positivamente a la clorofila a y al MEI, mientras que D. brevirostris respondió exclusivamente al MEI. Bajo el escenario SSP5-8.5 (2090), se proyecta una contracción neta de hábitat para B. polylepis (-37%), P. maculatofasciatus (-30.5%) y S. annulatus (-16%), una alta persistencia para H. elongatus (98.5%) y una expansión para D. brevirostris (+39.1%)..."